1481447-40-8
中文名稱
磺化Cy5-疊氮
英文名稱
3H-IndoliuM, 2-[5-[1-[6-[(3-azidopropyl)aMino]-6-oxohexyl]-1,3-dihydro-3,3-diMethyl-5-sulfo-2H-indol-2-ylidene]-1,3-pentadien-1-yl]-1,3,3-triMethyl-5-sulfo-, inner salt
CAS
1481447-40-8
分子式
C35H44N6O7S2
分子量
724.89
MOL 文件
1481447-40-8.mol
更新日期
2026/04/16 11:50:35
1481447-40-8 結(jié)構(gòu)式
基本信息
中文別名
磺化CY5-疊氮二磺酸-CY5-疊氮
英文別名
CY3-N3Cy5-N3
Sulfo-Cy5-N3
Sulfo-Cy5-N3, >97%
3H-IndoliuM, 2-[5-[1-[6-[(3-azidopropyl)aMino]-6-oxohexyl]-1,3-dihydro-3,3-diMethyl-5-sulfo-2H-indol-2-ylidene]-1,3-pentadien-1-yl]-1,3,3-triMethyl-5-sulfo-, inner salt
所屬類別
生物化工：熒光成像物理化學(xué)性質(zhì)
外觀性狀外觀 : 深藍(lán)色固體
ex/em : 649/672 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 271000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.28
ex/em : 649/672 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 271000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.28
儲存條件-20°C, protect from light
溶解度易溶于甲醇，DMF等有機(jī)溶劑，極易溶于水
形態(tài)Solid
顏色Brown to dark brown
外觀Dark blue solid
ε(消光系數(shù))271000 L?mol?1?cm?1
Φ(量子產(chǎn)率)0.28
激發(fā)峰(Ex)/發(fā)射峰(Em)649/672 nm (PBS buffer)
常見問題列表
概述
磺化Cy5-疊氮 是一種含有疊氮基的點擊化學(xué)試劑。Cy5 是用于成像的紅色熒光標(biāo)記染料 (Ex/Em=642/670 nm)。它含有 Azide 基團(tuán)，可以和含有 Alkyne 基團(tuán)的分子發(fā)生銅催化的疊氮-炔環(huán)加成反應(yīng)（CuAAc)。它還可以和含有 DBCO 或 BCN 基團(tuán)的分子發(fā)生環(huán)張力促進(jìn)的炔-疊氮環(huán)加成反應(yīng) (SPAAC)。熒光標(biāo)記染料
磺化Cy5是Cy5(Cyanine 5)的水溶型。它的光譜性質(zhì)和Cy5類似，在熒光顯微鏡下發(fā)遠(yuǎn)紅色熒光。它熒光亮，對pH不敏感，一般可以用633 nm或647 nm的激光束激發(fā)然后用 Cy5或APC濾片觀察，所以在絕大部分熒光儀器上都可以使用?；腔疌y5熒光落在遠(yuǎn)紅光區(qū)，使用磺化Cy5或者其它遠(yuǎn)紅光染料的一個重要優(yōu)勢是在這個長波長光譜范圍內(nèi)樣品背景熒光較低，而在這個區(qū)域CCD相機(jī)/檢測器檢測靈敏度最高?；腔疌y5可以用來標(biāo)記蛋白，抗體，多肽，核酸分子等。磺化Cy5水溶性非常好，可在水相標(biāo)記反應(yīng)體系中直接使用，不需要有機(jī)溶劑助溶，特別適合標(biāo)記對有機(jī)溶劑敏感的生物分子。另外由于強(qiáng)水溶性加染料分子本身帶電荷，磺化Cy5標(biāo)記到生物分子表面后不會引發(fā)疏水性聚集，提高熒光標(biāo)記產(chǎn)物的穩(wěn)定性。
疊氮(azide)是常用生物標(biāo)記基團(tuán)。通過點擊化學(xué)反應(yīng)(click chemistry)，疊氮可以和一系列炔烴(alkyne)或環(huán)炔烴(strained alkyne)生成穩(wěn)定的生物鏈接(bioconjugate)。點擊化學(xué)反應(yīng)效率很高，可在水相中(也可有機(jī)相)快速定量完成(幾乎100%產(chǎn)率)，即使在低濃度(μM)和低溫(4oC)下也可完成。點擊化學(xué)反應(yīng)技術(shù)發(fā)展很成熟，各種相關(guān)試劑商業(yè)可得，各種生物標(biāo)記應(yīng)用廣泛。
磺化Cy5標(biāo)記后的產(chǎn)物Ex/Em是649/672nm。和它具有相似熒光特性的染料包括Alexa Fluor 647，DyLight 649，ATTO 647等。
注意事項
- 磺化Cy5水溶性高，極性強(qiáng)，如需脂溶性標(biāo)記染料，請選擇普通Cy5-疊氮。
- 疊氮化合物可被強(qiáng)還原劑(如DTT)還原破壞，使用時務(wù)必去除還原劑。
- 標(biāo)記反應(yīng)不要放在強(qiáng)光下，因為大部分熒光化合物在強(qiáng)光下長時間照射會緩慢光漂泊(photobleaching)。