154757-99-0
154757-99-0 結(jié)構(gòu)式
基本信息
英文別名
POPO 3POPO 3 IODIDE
BENZOXAZOLIUM, 2,2'-[1,3-PROPANEDIYLBIS[(DIMETHYLIMINIO)-3,1-PROPANEDIYL-1(4H)-PYRIDINYL-4-YLIDENE-1-PROPEN-1-YL-3-YLIDENE]]BIS[3-METHYL-, TETRAIODIDE
2-((E)-3-[1-(3-[[3-(DIMETHYL(3-[4-[(E)-3-(3-METHYL-1,3-BENZOXAZOL-3-IUM-2-YL)-2-PROPENYLIDENE]-1(4H)-PYRIDINYL]PROPYL)AMMONIO)PROPYL](DIMETHYL)AMMONIO]PROPYL)-4(1H)-PYRIDINYLIDENE]-1-PROPENYL)-3-METHYL-1,3-BENZOXAZOL-3-IUM TETRAIODIDE
物理化學(xué)性質(zhì)
外觀性狀ex/em : 534/570 nm
消光系數(shù)(ε) : 146400 cm?1M?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.46
消光系數(shù)(ε) : 146400 cm?1M?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.46
熔點(diǎn)>250℃
溶解度Soluble in N,N-dimethylformamide
形態(tài)powder
顏色Yellow-brown
ε(消光系數(shù))146400 cm?1M?1
Φ(量子產(chǎn)率)0.46
激發(fā)峰(Ex)/發(fā)射峰(Em)534/570 nm
最大波長(λmax)534 nm
生物領(lǐng)域應(yīng)用Nucleic acid hybridization; detecting nucleic acids,cells,hepatitis B virus,pathogens; counting embryoblasts; biochips; nucleic acid fragment sizing
主要應(yīng)用Photonic fabric display
常見問題列表
熒光顯影染料
PoPo-3是高靈敏核酸顯影劑，常用于細(xì)胞核顯影。PoPo-3是PO-PRO-3的二連體(dimer)，屬雙菁類(Cyanine dimers)熒光探針。雙菁類探針由兩個(gè)單菁染料分子(一般來自托普家族，TO-PRO family)對稱鏈接而成，共帶4個(gè)正電荷。這個(gè)結(jié)構(gòu)大大增強(qiáng)了其對DNA的親和性，親和能力提高可達(dá)100倍。另外，雙菁類探針本身沒有熒光，但是嵌入DNA后熒光增強(qiáng)100-1000倍，屬已知最強(qiáng)最亮的一類核酸顯影劑之一，它們的靈敏度甚至達(dá)到可以顯影單個(gè)DNA鏈(Science 264, 822 (1994))。雙菁類探針也包含10個(gè)家族成員，它們的顯影熒光也可覆蓋所有可見光光譜范圍，從456nm(PoPo-1)到660nm(ToTo-3)，因此從它們中總能找到一個(gè)譜段合適的探針。雙菁類探針難于透過細(xì)胞膜，適用于已固定細(xì)胞的細(xì)胞核對染(counterstaining)，可用于流式細(xì)胞儀或者熒光顯微鏡實(shí)驗(yàn)。雙菁類探針也用于瓊脂糖膠核酸顯影。
PoPo-3與核酸或細(xì)胞核結(jié)合后顯黃色熒光(ex/em ~ 534/570 nm)。