2231670-85-0
中文名稱
Cyanine3.5-琥珀酰亞胺/活化酯
英文名稱
Cyanine3.5 NHS ester
CAS
2231670-85-0
分子式
C42H44N3O4+
分子量
654.83
MOL 文件
2231670-85-0.mol
更新日期
2026/05/25 12:40:38
2231670-85-0 結(jié)構(gòu)式
基本信息
中文別名
花青素CY3.5活性酯CY3.5-琥珀酰亞胺酯
CY3.5-NHS 活化酯
花青素CY3.5琥珀酰亞胺酯
CYANINE3.5-琥珀酰亞胺/活化酯
CY3.5 NHS ESTER/琥珀酰亞胺活化酯(METHYL)
英文別名
Cyanine3.5 NHS ester 所屬類別
化學(xué)試劑：其他酯類化合物物理化學(xué)性質(zhì)
外觀性狀外觀 : 深紫色固體
ex/em : 591/604 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 116000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.35
ex/em : 591/604 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 116000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.35
溶解度易溶于DMF等有機溶劑
形態(tài)powder
外觀Dark purple solid
ε(消光系數(shù))116000 L?mol?1?cm?1
Φ(量子產(chǎn)率)0.35
激發(fā)峰(Ex)/發(fā)射峰(Em)591/604 nm (PBS buffer)
InChIKeyMLTQHYXPKJXNSU-UHFFFAOYSA-N
SMILESCC1(C(=[N+](CCCCCC(=O)ON2C(CCC2=O)=O)C2C=CC3=CC=CC=C3C1=2)C=CC=C1N(C2C=CC3=CC=CC=C3C=2C1(C)C)C)C
應(yīng)用領(lǐng)域
用途一
Cyanine3.5 NHS ester is a reactive dye for the labeling of amino-groups in peptides, proteins, and oligonucleotides._x000D_
_x000D_
Cyanine3.5 NHS ester can replace NHS esters of Cy3.5, Alexa Fluor 594, DyLight 594.常見問題列表
熒光標記染料
Cy3.5 (Cyanine 3.5) 是一種發(fā)紅色熒光的花青素類熒光染料。Cy3.5在顯影時可以用561nm或者594nm的激光束激發(fā)然后用 Texas Red? 相似的濾片觀察，它是一種非常常用的標記染料。Cy3.5-NHS可以用來標記蛋白，抗體，多肽,核酸分子等。NHS活化酯 （N-羥基琥珀酰亞胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester）是生物標記反應(yīng)中最常用的活化基團。它活化Cy3.5分子中的羧基，讓它可以和目標生物分子上的胺基（伯胺或者仲胺）反應(yīng)生成穩(wěn)定的酰胺鍵，從而把Cy3.5分子標記到生物大分子上。由于游離胺基是蛋白，抗體，多肽表面的常見官能團（來自于賴胺酸側(cè)鏈），Cy3.5-NHS可以和它們直接反應(yīng)。核酸分子中天然不帶游離胺基，只有胺基修飾過的RNA或者DNA才可以和Cy3.5-NHS反應(yīng)。
Cy3.5-NHS活化酯的水溶性較低，所以在水相的標記反應(yīng)體系內(nèi)需要使用有機共溶劑，常用有機溶劑包括DMF，DMSO和乙腈等。如需標記的分子對有機溶劑敏感，可選擇磺化花青素（sulfonated cyanine），即sulfo-Cy3.5-NHS活化酯。兩者的光譜性質(zhì)幾乎一致，因此大部分應(yīng)用可相互替換。兩者的主要區(qū)別在于：磺化染料是水溶性的，在水相的標記反應(yīng)體系內(nèi)不需要使用有機共溶劑，并且降低染料在水中聚集的可能性，增強標記效率。
注意事項
- NHS ester基團對濕度比較敏感，務(wù)必干燥保存產(chǎn)品。使用前產(chǎn)品需放到室溫回溫至少20分鐘。
- 使用不含氨基的緩沖體系。比如磷酸鈉緩沖液（PBS），Hepes緩沖液，碳酸氫鈉緩沖液，或硼酸緩沖液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的緩沖液，比如Tris，甘氨酸等。高濃度咪唑(imidazole)也會影響反應(yīng)。
- 標記反應(yīng)不要放在強光下，因為大部分熒光化合物在強光下長時間照射會緩慢光漂泊(photobleaching)。