407627-61-6
中文名稱
AF 647 NHS ESTER,TEA SALT
英文名稱
3H-Indolium, 2-[5-[1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-2H-indol-2-ylidene]-1,3-pentadien-1-yl]-3-[6-[(2,5-dioxo-1-pyrrolidinyl)oxy]-6-oxohexyl]-3-methyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-, inner salt, compd. with N,N-diethylethanamine (1:3)
CAS
407627-61-6
分子式
C46H64N4O16S4
分子量
1057.27
MOL 文件
407627-61-6.mol
407627-61-6 結(jié)構(gòu)式
基本信息
中文別名
OKF647(C6) 琥珀酰胺亞胺酯.三乙胺鹽AF 647 NHS ESTER,TEA SALT
英文別名
AF647-NHS ester triTEA3H-Indolium, 2-[5-[1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-2H-indol-2-ylidene]-1,3-pentadien-1-yl]-3-[6-[(2,5-dioxo-1-pyrrolidinyl)oxy]-6-oxohexyl]-3-methyl-5-sulfo-1-(3-sulfopropyl)-, inner salt, compd. with N,N-diethylethanamine (1:3)
物理化學性質(zhì)
外觀性狀外觀 : 深藍色固體
ex/em : 651/672 nm
消光系數(shù)(ε) : 261,000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.33
ex/em : 651/672 nm
消光系數(shù)(ε) : 261,000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.33
溶解度易溶于水, DMSO, DMF等
形態(tài)Solid
顏色Blue to dark blue
外觀Dark blue solid
ε(消光系數(shù))261,000 L?mol?1?cm?1
Φ(量子產(chǎn)率)0.33
激發(fā)峰(Ex)/發(fā)射峰(Em)651/672 nm
常見問題列表
概述
AF647-NHS ester 是 Alexa Fluor 647 (AF647) 的類似物，AF647 的激發(fā)波長 (λex) 為 635 nm (常規(guī)熒光檢測)/620 nm (瞬時檢測)。熒光標記染料
AF647（Alexa Fluor 647）是Alexa Fluor染料家族中一種發(fā)遠紅（far-red）熒光的染料，是最常用的一種AF染料之一，在重要實驗中，常常被用于替代Cy5染料。AF647的極性大，水溶性極好，熒光穩(wěn)定性能也不錯，能耐受較長時間照射，特別適應(yīng)于標記蛋白質(zhì)，是二抗標記的常規(guī)熒光染料。盡管AF647的量子產(chǎn)率不算高，但是其消光系數(shù)非常高（即表現(xiàn)為顏色深，分子吸收光子能力強），所以AF647的熒光亮度很高，另外，由于遠紅光區(qū)樣品背景弱，而CCD相機對該區(qū)光子檢測都較靈敏，所以各種因素加成之下，讓AF647成為最靈敏的熒光染料之一，常?？蓹z測出豐度非常低的樣品。AF647的ex/em和Cy5非常接近，因此在常規(guī)熒光顯微鏡時可使用Cy5濾片組；在共聚焦顯微成像時，633nm激光束可以良好的激發(fā)該染料，594nm激光也可以通過該染料的肩峰激發(fā)，很好的適配了生物實驗室常規(guī)平臺激光器，包括常規(guī)共聚焦顯微鏡、流式細胞儀和熒光掃描儀等。NHS活化酯(N-羥基琥珀酰亞胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester, SE)是生物標記反應(yīng)中最常用的活化基團。NHS活化AF647分子中的羧基，讓它可以和目標生物分子上的胺基（主要伯胺）反應(yīng)生成穩(wěn)定的酰胺鍵，從而把AF647熒光分子標記到生物大分子上。