全基因組甲基化測序(WGBS)概述[1][2]
DNA甲基化是表觀遺傳學(Epigenetics)的重要組成部分,在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發(fā)育以及人類腫瘤發(fā)生中起著重要的作用。全基因組甲基化測序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS),其采用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA使未甲基化修飾的胞嘧啶C轉(zhuǎn)化為尿嘧啶U,通過對處理后的DNA進行全基因組重測序,并與參考基因組進行比對,從基因組水平實現(xiàn)單堿基分辨率的、高精確度甲基化水平分析,廣泛應用于細胞分化、組織發(fā)育等基礎機制研究,以及動植物育種、人類健康與疾病治療等研究領(lǐng)域。
全基因組甲基化測序(WGBS)優(yōu)勢[1][2]
全基因組甲基化測序(WGBS)在1992年由Frommer等提出被公認為一項革命性的創(chuàng)新,已成為繪制單堿基DNA甲基化圖譜的首選方法。該方法因其通量高、耗時少、單堿基分辨率、高覆蓋率的優(yōu)勢被稱為甲基化測序的“黃金標準”。
測精度高:單堿基分辨率,精確分析每一個C堿基的甲基化狀態(tài);
檢測范圍廣:借助高通量測序平臺,對全基因組范圍內(nèi)甲基化區(qū)域進行研究;
可靠性高:直接對甲基化片段進行測序和定量,無交叉反應和背景噪音;
性價比高:相比傳統(tǒng)PCR+Sanger測序方法,使用抗體富集高甲基化區(qū)域測序,費用少。
主要參考文獻
1.DNA甲基化測序技術(shù)及其在哺乳動物中的應用研究進展?!渡飳W雜志》2018年第5期79-82,86共5頁。