磺化Cy5 炔基
| 中文名稱 | 磺化Cy5 炔基 |
|---|---|
| 中文同義詞 | 二磺酸-CY5-炔基;SULFO CY5-炔基;磺化CY5 炔基;水溶性菁染料CY5炔基;水溶性花菁染料CY5標記炔烴;水溶CY5-炔基 |
| 英文名稱 | diSulfo-Cy5 alkyne |
| 英文同義詞 | diSulfo-Cy5 alkyne |
| CAS號 | 1617497-19-4 |
| 分子式 | C35H42N3NaO7S2 |
| 分子量 | 703.84 |
| EINECS號 | |
| 相關類別 | 化學試劑 |
| Mol文件 | 1617497-19-4.mol |
| 結構式 | ![]() |
磺化Cy5 炔基 性質
| 溶解度 | 溶于水、DMSO、DMF、DCM |
|---|---|
| 外觀 | Dark blue solid |
| 激發(fā)峰(Ex)/發(fā)射峰(Em) | 649/672 nm (PBS buffer) |
| ε(消光系數(shù)) | 271000 L?mol?1?cm?1 |
| Φ(量子產(chǎn)率) | 0.28 |
| InChIKey | XKVHPAQUKWEXLO-UHFFFAOYSA-N |
| SMILES | C(N1C(C(C)(C)C2=CC(S(O)(=O)=O)=CC=C12)=CC=CC=CC1=[N+](C2=CC=C(S([O-])(=O)=O)C=C2C1(C)C)C)CCCCC(=O)NCC#C.[NaH] |
磺化Cy5 炔基 是一種熒光染料,可作為點擊化學試劑。磺化Cy5是Cy5(Cyanine 5)的水溶型。它的光譜性質和Cy5類似,在熒光顯微鏡下發(fā)遠紅色熒光。它熒光亮,對pH不敏感,一般可以用633 nm或647 nm的激光束激發(fā)然后用 Cy5或APC濾片觀察,所以在絕大部分熒光儀器上都可以使用?;腔疌y5熒光落在遠紅光區(qū),使用磺化Cy5或者其它遠紅光染料的一個重要優(yōu)勢是在這個長波長光譜范圍內樣品背景熒光較低,而在這個區(qū)域CCD相機/檢測器檢測靈敏度最高?;腔疌y5可以用來標記蛋白,抗體,多肽,核酸分子等。
磺化Cy5水溶性非常好,可在水相標記反應體系中直接使用,不需要有機溶劑助溶,特別適合標記對有機溶劑敏感的生物分子。另外由于強水溶性加染料分子本身帶電荷,磺化Cy5標記到生物分子表面后不會引發(fā)疏水性聚集,提高熒光標記產(chǎn)物的穩(wěn)定性。
炔烴(alkyne)是常用生物標記基團。通過銅催化點擊化學反應(Copper-catalyzed azide–alkyne cycloaddition, CuAAC),炔烴可以和疊氮(azide)生成穩(wěn)定的生物鏈接(bioconjugate)。點擊化學反應效率很高,可在水相中(也可有機相)快速完成,即便在低濃度(μM)下。點擊化學反應技術發(fā)展很成熟,各種相關試劑商業(yè)易得,各種生物標記應用廣泛。
磺化Cy5標記后的產(chǎn)物Ex/Em是649/672nm。和它具有相似熒光特性的染料包括Alexa Fluor 647,DyLight 649,ATTO 647等。
ex/em : 649/672 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 271000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.28
磺化Cy5水溶性非常好,可在水相標記反應體系中直接使用,不需要有機溶劑助溶,特別適合標記對有機溶劑敏感的生物分子。另外由于強水溶性加染料分子本身帶電荷,磺化Cy5標記到生物分子表面后不會引發(fā)疏水性聚集,提高熒光標記產(chǎn)物的穩(wěn)定性。
炔烴(alkyne)是常用生物標記基團。通過銅催化點擊化學反應(Copper-catalyzed azide–alkyne cycloaddition, CuAAC),炔烴可以和疊氮(azide)生成穩(wěn)定的生物鏈接(bioconjugate)。點擊化學反應效率很高,可在水相中(也可有機相)快速完成,即便在低濃度(μM)下。點擊化學反應技術發(fā)展很成熟,各種相關試劑商業(yè)易得,各種生物標記應用廣泛。
磺化Cy5標記后的產(chǎn)物Ex/Em是649/672nm。和它具有相似熒光特性的染料包括Alexa Fluor 647,DyLight 649,ATTO 647等。
- 磺化Cy5水溶性高,極性強,如需脂溶性標記染料,請選擇普通Cy5-炔烴。
- 標記反應不要放在強光下,因為大部分熒光化合物在強光下長時間照射會緩慢光漂泊(photobleaching)。
化學性質
外觀 : 深藍色固體ex/em : 649/672 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 271000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.28
