肝素酶I（heparinase I）可降解肝素和硫酸乙酰肝素，是肝素結(jié)構(gòu)研究、臨床診斷和工業(yè)質(zhì)控的有力工具。 肝素酶I選擇性地切斷肝素和硫酸乙酰肝素(相對活性約3:1)在葡萄糖胺和O-硫酸艾杜糖醛酸之間的連鍵，產(chǎn)物主要是二糖。此酶也能切斷肝素分子中的抗凝血酶III結(jié)合五糖位點。

肝素酶I的作用機理： 肝素酶可選擇地剪切硫酸化肝素聚糖中葡萄糖胺和糖醛酸之間的α(1-4)糖苷鍵。此剪切過程通過消除反應完成，產(chǎn)生包含不飽和糖醛酸殘基(雙鍵位于C4和C5之間)的寡糖。降解產(chǎn)物可由紫外光譜儀檢測(232 nm)。

肝素酶在科學研究和工業(yè)上具有廣泛的用途，如：

1. 降解肝素以進行結(jié)構(gòu)分析，如依諾肝素鈉1,6-成環(huán)率測試、肝素鈉二糖譜分析 ；

2 對肝素進行部分降解得到低分子肝素，并進行化學修飾或接枝到其他材料上；

3 降解肝素粗品，從而檢測其來源（qPCR法） 降解肝素和硫酸乙酰肝素，以制備肝素二糖和肝素寡糖。