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UNC0638

UNC0638 是一種有效的選擇性的組蛋白賴氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶(HMTase)抑制劑,作用于G9aGLP,IC50分別為< 15 nM和19 nM,有效且選擇性地作用于多種表觀遺傳和非表觀遺傳靶點(diǎn)。UNC0638 具有抗病毒的活性。

UNC0638 Chemical Structure

UNC0638 Chemical Structure

CAS: 1255580-76-7

規(guī)格 價格 庫存 購買數(shù)量
10mM (1mL in DMSO) 1285.83 現(xiàn)貨
10mg 1193.17 現(xiàn)貨
50mg 3840.11 現(xiàn)貨
1g 30303 現(xiàn)貨
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細(xì)胞實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)示例

細(xì)胞系 實(shí)驗(yàn)類型 給藥濃度 孵育時間 活性描述 文獻(xiàn)信息(PMID)
H1299 cells Function assay 0.25 uM 24 h Inhibition of G9a expressed in H1299 cells assessed as inhibition of dimethylation of p53 at lys 373 at 0.25 uM after 24 hrs by Western blot analysis
MDA-MB-231 cells Function assay 48 h Inhibition of G9a in human MDA-MB-231 cells after 48 hrs by clonogenic assay, IC50=0.081 μM
22Rv1 cells Function assay Inhibition of G9a in human 22Rv1 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.048 μM
PC3 cells Function assay Inhibition of G9a in human PC3 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.059 μM
MCF7 cells Function assay Inhibition of G9a in human MCF7 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.07 μM
IMR90 cells Function assay Inhibition of G9a in human IMR90 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.12 μM
HCT116 cells Function assay Inhibition of G9a in human HCT116 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.21 μM
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生物活性

產(chǎn)品描述 UNC0638 是一種有效的選擇性的組蛋白賴氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶(HMTase)抑制劑,作用于G9aGLP,IC50分別為< 15 nM和19 nM,有效且選擇性地作用于多種表觀遺傳和非表觀遺傳靶點(diǎn)。UNC0638 具有抗病毒的活性。
靶點(diǎn)
G9a
(Cell-free assay)
GLP
(Cell-free assay)
<15 nM 19 nM
體外研究(In Vitro)
體外研究活性 UNC0638是一種有效的,選擇性的,可滲透細(xì)胞的G9aGLP的化學(xué)探針,相比于BIX01294,毒性/功能比小于6,其毒性/功能比大于100。UNC0638是一種有效的G9a和GLP抑制劑,對廣譜的表觀遺傳和非表觀遺傳靶點(diǎn)有選擇性。UNC0638對SET7/9 (a H3K4 HMTase),SET8 (a H4K20 HMTase),PRMT3,以及SUV39H2有大于10,000倍的選擇性。在MDA-MB-231細(xì)胞中,UNC0638 (48 h處理)以濃度依賴的方式降低H3K9me2水平,IC50 是81 nM。UNC0638處理各種細(xì)胞系導(dǎo)致較低的全局H3K9me2水平降低,這與用shRNA降低G9a和GLP觀測到的效果是一致的。UNC0638顯著降低MCF7細(xì)胞的克隆形成能力,降低G9a調(diào)控的內(nèi)源基因的啟動子區(qū)H3K9me2的豐度,同時影響microRNAs。在小鼠胚胎干細(xì)胞中,UNC0638以濃度依賴的方式重新激活G9a沉默的基因和一個報告基因,同時不促進(jìn)分化。
激酶實(shí)驗(yàn) SAHH耦合試驗(yàn)
這個實(shí)驗(yàn)在腺苷脫氨酶的作用將腺苷轉(zhuǎn)換為肌苷,利用SAHH分解甲基轉(zhuǎn)移酶產(chǎn)生的S-腺苷高半胱氨酸,形成同型半胱氨酸和腺苷。同型半胱氨酸的濃度通過偶聯(lián)熒光基團(tuán)ThioGlo測定。IC50測定,反應(yīng)緩沖液如下:25 mM 磷酸鉀緩沖液pH 7.5,1 mM EDTA,2 mM MgCl2,含 5 μM SAHH 的0.01% Triton X 100,0.3 U/mL 腺苷脫氨酶,25 μM SAM,以及15 μM ThioGlo。G9a, EHMT1, SETD7, SETD8, PRMT3以及SUV39H2分別在25 nM, 100 nM, 200 nM, 250 nM, 1 μM 和100 nM的濃度下測量。UNC0638以4 nM 到 16 μM的濃度加入緩沖液。孵育2分鐘后,加入組蛋白多肽觸發(fā)反應(yīng),G9a 中加入10 μM H3(1-25),EHMT1中加入20 μM H3(1-25),SETD7中加入100 μM H3(1-25) ,SETD8中加入500 μM H4(1-24),PRMT3中加入10 μM H4(1-24) ,SUV39H2中加入200 μM H3K9Me1 (1-15)。在384孔板中,用Biotek Synergy2 plate reader在360/40 nm 感光片和528/20 nm濾光片下觀測甲基化反應(yīng)過程中熒光的變化,持續(xù)20分鐘??鄢龑?shí)驗(yàn)背景后,用Sigmaplot計(jì)算IC50。計(jì)算兩組獨(dú)立實(shí)驗(yàn)的標(biāo)準(zhǔn)差。
細(xì)胞實(shí)驗(yàn) 細(xì)胞系 MCF7, U2OS 和 H1299細(xì)胞
濃度 3 μM
孵育時間 65 h
方法

將約為5×105的細(xì)胞鋪于75 cm2燒瓶中。MCF7和U2OS細(xì)胞培養(yǎng)于不含酚紅、而包含Earl's salts、10% FBS、1 mM Pyruvate、2 mM Glutamine和1×非必需氨基酸的MEM培養(yǎng)基中。H1299細(xì)胞培養(yǎng)于含酚紅和10% FBS、1×Anti-Anti的DMEM培養(yǎng)基中。向培養(yǎng)基中加入3 μM UNC638A或等體積DMSO。將燒瓶置于37℃/5% CO2培養(yǎng)箱中。65小時后,收集培養(yǎng)基、離心以移除其中細(xì)胞碎片。將10-15 mL培養(yǎng)基與HPLC級別的氯仿混合,輕輕搖晃,然后靜置,知道有機(jī)層和水層分離開來。收集有機(jī)相,用無水Na2SO4進(jìn)行干燥,然后真空中收集濃縮。剩余殘?jiān)苡?00 μL 甲醇,進(jìn)行后續(xù)分析。

體內(nèi)研究(In Vivo)
體內(nèi)研究活性 在小鼠中進(jìn)行的藥物代謝和藥代動力學(xué)研究表明,UNC0638經(jīng)靜脈注射、腹腔注射或口服途徑給藥,在體內(nèi)清除率高、半衰期短、高體積分布和低暴露量。
動物實(shí)驗(yàn) Animal Models Swiss albino mice
Dosages IV, 1 mg/kg; PO, 3 mg/kg; IP, 2.5 mg/kg
Administration i.v./i.p./oral
  • [1]https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21743462/

化學(xué)信息&溶解度

分子量 509.73 分子式

C30H47N5O2

CAS號 1255580-76-7 SDF Download UNC0638 SDF
Smiles CC(C)N1CCC(CC1)NC2=NC(=NC3=CC(=C(C=C32)OC)OCCCN4CCCC4)C5CCCCC5
儲存條件(自收到貨起)

體外溶解度
批次:

DMSO : 100 mg/mL ( (196.18 mM) ;DMSO吸濕會降低化合物溶解度,請使用新開封DMSO)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

摩爾濃度計(jì)算器

體內(nèi)溶解配方
批次:

現(xiàn)配現(xiàn)用,請按從左到右的順序依次添加,澄清后再加入下一溶劑

動物體內(nèi)配方計(jì)算器

實(shí)驗(yàn)計(jì)算

摩爾濃度計(jì)算器

質(zhì)量 濃度 體積 分子量

動物體內(nèi)配方計(jì)算器(澄清溶液)

第一步:請輸入基本實(shí)驗(yàn)信息(考慮到實(shí)驗(yàn)過程中的損耗,建議多配一只動物的藥量)

mg/kg g μL

第二步:請輸入動物體內(nèi)配方組成(配方適用于不溶于水的藥物;不同批次藥物配方比例不同,請聯(lián)系Selleck為您提供正確的澄清溶液配方)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

計(jì)算結(jié)果:

工作液濃度: mg/ml;

DMSO母液配制方法: mg 藥物溶于μL DMSO溶液(母液濃度mg/mL,:如該濃度超過該批次藥物DMSO溶解度,請先聯(lián)系Selleck);

體內(nèi)配方配制方法:μL DMSO母液,加入μL PEG300,混勻澄清后加入μL Tween 80,混勻澄清后加入μL ddH2O,混勻澄清。

體內(nèi)配方配制方法:μL DMSO母液,加入μL Corn oil,混勻澄清。

注意:1. 首先保證母液是澄清的;
2.一定要按照順序依次將溶劑加入,進(jìn)行下一步操作之前必須保證上一步操作得到的是澄清的溶液,可采用渦旋、超聲或水浴加熱等物理方法助溶。

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