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熱門分子 | Puromycin dihydrochloride——新生肽鏈標(biāo)記專家

發(fā)布日期:2026/7/20 11:51:38發(fā)布人:上海陶術(shù)生物科技有限公司閱讀量:17

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嘌呤霉素二鹽酸鹽

123 2024-09-13

公眾號表頭.png

產(chǎn)品介紹


Puromycin dihydrochloride

別名:嘌呤霉素二鹽酸鹽水合物、嘌呤霉素二鹽酸鹽、Puromycin 2HCl、CL13900 dihydrochloride

貨號:T2219

CAS號:58-58-2


Puromycin dihydrochloride(CL13900 dihydrochloride)屬于氨基核苷類抗生素,是一種蛋白質(zhì)合成的抑制劑。Puromycin dihydrochloride通過模擬氨酰 - tRNA 進入核糖體 A 位點,導(dǎo)致肽鏈提前終止。

圖1jpg.jpg

Puromycin dihydrochloride分子結(jié)構(gòu)式


背景介紹


蛋白質(zhì)合成是細胞生命活動的核心過程,其關(guān)鍵催化單元是真核生物和原核生物的核糖體(ribosome)。核糖體是由大、小兩個亞基組成的核糖核蛋白復(fù)合體,通過識別信使RNA(mRNA)并協(xié)調(diào)氨基酸轉(zhuǎn)移RNA(tRNA)在A、P、E位點的進出,實現(xiàn)多肽鏈的延伸。在核糖體的大亞基中,肽基轉(zhuǎn)移中心(peptidyl transferase center, PTC)負責(zé)形成肽鍵,是蛋白質(zhì)合成的催化中心。PTC的位置高度保守,對催化效率和翻譯準確性至關(guān)重要,因此成為多種抗生素和翻譯抑制劑的主要靶點。PTC的三維構(gòu)象和功能特性已在多個高分辨率晶體結(jié)構(gòu)中得到解析,這些結(jié)構(gòu)為理解藥物與核糖體相互作用提供了基礎(chǔ)[1]。


圖2jpg.jpg

核糖體結(jié)構(gòu)與mRNA翻譯[1]


Puromycin是一種氨基核苷類似物,因其結(jié)構(gòu)與氨基酸連接的tRNA 3′端相似而能夠進入核糖體的A位點。在翻譯延長階段,Puromycin可以作為的氨基酸–tRNA結(jié)構(gòu)類似物參與肽鏈的形成。在肽基轉(zhuǎn)移反應(yīng)中,PTC會將正在P位點的多肽鏈轉(zhuǎn)移到Puromycin上,形成Puromycin–多肽的共價連接。然而由于Puromycin缺乏tRNA的完整部分,它無法繼續(xù)參與正常的肽鏈延伸,從而導(dǎo)致多肽鏈過早終止。這個機制被廣泛利用于研究蛋白質(zhì)合成動力學(xué)以及檢測新生多肽,例如Puromycin標(biāo)記法(puromycylation)能夠直接反映活躍翻譯事件。Puromycin的這種作用機制不僅闡明了翻譯過程中的分子細節(jié),同時也展示了靶向PTC抑制劑在細胞生物學(xué)和藥物開發(fā)中的重要性[2]。


文獻精選


文章 1 :

A puromycin-dependent activity-based sensing probe for histochemical staining of hydrogen peroxide in cells and animal tissues


圖3jpg.jpg

該研究構(gòu)建了一種依賴Puromycin的活性響應(yīng)型探針,用于在細胞與動物組織中進行過氧化氫(H2O2)的組織化學(xué)染色與成像。利用Puromycin可被核糖體摻入新生多肽鏈的特性,將其與對H2O2敏感的化學(xué)響應(yīng)基團進行分子耦聯(lián),設(shè)計出一種只有在存在過氧化氫時才被激活并參與蛋白質(zhì)翻譯摻入的探針分子。該策略使得探針信號與活躍翻譯區(qū)域和氧化應(yīng)激水平在空間上高度耦合,隨后通過抗-Puromycin抗體進行免疫染色,實現(xiàn)對細胞和組織內(nèi)H?O?分布的高分辨率可視化。研究系統(tǒng)驗證了該探針在培養(yǎng)細胞和小鼠組織切片中的可行性與特異性,證明其能夠在復(fù)雜生物環(huán)境中實現(xiàn)對氧化還原狀態(tài)的精準組織化學(xué)標(biāo)記[3]。


圖4jpg.jpg

用Peroxymycin-1檢測正常飲食和高脂飲食小鼠肝組織中H2O2水平[3]


文章 2 :

Puromycin-induced kidney injury and subsequent regeneration in adult zebrafish


圖5jpg.jpg

該研究建立了一個以Puromycin誘導(dǎo)為基礎(chǔ)的成年斑馬魚腎損傷與再生模型,用于研究腎臟損傷后的組織修復(fù)與再生機制。研究通過向成年Zebrafish體內(nèi)給藥Puromycin,引發(fā)可重復(fù)且可控的腎小管上皮損傷,隨后利用組織學(xué)染色、免疫標(biāo)記及分子表達分析,系統(tǒng)追蹤損傷發(fā)生后的炎癥反應(yīng)、細胞凋亡、增殖及新生腎單位形成過程。結(jié)果表明,Puromycin處理能夠在短時間內(nèi)誘導(dǎo)明顯的腎小管壞死與功能障礙,但斑馬魚具有顯著的再生能力,能夠通過激活前體細胞增殖和新生腎單位形成實現(xiàn)結(jié)構(gòu)與功能的恢復(fù)。該模型提供了證據(jù),表明普羅霉素誘導(dǎo)成年斑馬魚腎臟損傷是評估腎單位損傷及后續(xù)再生機制的潛在工具。

圖6jpg.jpg

成年斑馬魚的腎單位在普霉素損傷后再生[4]




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參考文獻


[1] Steitz TA. A structural understanding of the dynamic ribosome machine. Nat Rev Mol Cell Biol. 2008 Mar;9(3):242-53. doi: 10.1038/nrm2352. PMID: 18292779.


[2] Schmidt EK, Clavarino G, Ceppi M, Pierre P. SUnSET, a nonradioactive method to monitor protein synthesis. Nat Methods. 2009 Apr;6(4):275-7. doi: 10.1038/nmeth.1314. Epub 2009 Mar 22. PMID: 19305406.


[3] Hoshi K, Messina MS, Ohata J, Chung CY, Chang CJ. A puromycin-dependent activity-based sensing probe for histochemical staining of hydrogen peroxide in cells and animal tissues. Nat Protoc. 2022 Jul;17(7):1691-1710. doi: 10.1038/s41596-022-00694-7. Epub 2022 May 13. PMID: 35562423; PMCID: PMC10233361.


[4] Koun S, Park HJ, Jung SM, Cha JJ, Cha DR, Kang YS. Puromycin-induced kidney injury and subsequent regeneration in adult zebrafish. Anim Cells Syst (Seoul). 2023 Apr 20;27(1):112-119. doi: 10.1080/19768354.2023.2203211. PMID: 37089626; PMCID: PMC10120544.




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