結合微生物保藏、PCR物種鑒定等相關實驗背景,多株混合菌體系中單獨純化單一菌株,可通過梯度稀釋分離、選擇性篩選、分子輔助驗證的全流程方案實現(xiàn),具體詳細操作如下:
一、梯度稀釋涂布初分離
將混合菌液用無菌生理鹽水進行10倍梯度稀釋,依次得到10-1到10-8的系列稀釋液,根據(jù)混合菌的濃度選擇3個合適的低濃度梯度。
取每個梯度的稀釋液涂布到對應的非選擇性固體培養(yǎng)基上,置于適宜溫度的培養(yǎng)箱中培養(yǎng)12~48小時,待單菌落充分長出,不同菌株會形成形態(tài)、顏色、大小有明顯差異的獨立單菌落。
二、針對性選擇性篩選
根據(jù)目標菌株的生理特性,配制專屬選擇性培養(yǎng)基,比如添加特定抗生素、碳源/氮源,抑制混合體系中其他雜菌的生長,僅讓目標菌株正常增殖,大幅降低分離難度。
結合目標菌株的功能特性,比如產酶、抑菌特性,在篩選平板上加入對應的顯色底物,目標菌落周圍會形成透明圈、顯色圈,可直接快速定位目標單菌落。
三、連續(xù)純化傳代驗證
挑取初篩得到的疑似目標單菌落,在新的純化平板上連續(xù)劃線傳代3~5次,每次傳代后觀察菌落形態(tài)是否完全均一,排除仍存在少量雜菌的混合菌落。
挑取純化后的單菌落接種到液體培養(yǎng)基中培養(yǎng),鏡檢觀察菌體形態(tài)是否完全一致,初步確認體系中僅存在單一菌株。
四、分子鑒定最終確認
提取純化后菌株的基因組DNA,用16S rRNA通用引物進行PCR擴增測序,將測序結果和NCBI數(shù)據(jù)庫比對,100%匹配目標菌株的序列,即可確認單一菌株純化完成,完全排除近緣雜菌殘留的可能。
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