? ? ? ?幾乎所有對蛋白質功能、表達、定位、修飾和相互作用的研究,都始于一個關鍵步驟:將蛋白質從其復雜的細胞或組織環(huán)境中釋放出來,即細胞裂解與蛋白質提取。一個成功的裂解方案必須實現(xiàn)兩個看似矛盾的目標:其一,要足夠“暴力”,能夠徹底打破細胞膜、細胞壁(對于植物和某些微生物)以及組織基質的屏障;其二,又要足夠“溫和”,可以最大限度地保護目標蛋白質免于降解、變性、氧化或非特異性聚集,從而保持其天然的結構和生物活性。
然而,生物樣本的多樣性為這一過程帶來了巨大的挑戰(zhàn)。堅韌的植物細胞壁、富含結締組織的動物肌肉、充滿高豐度干擾蛋白的血液樣本,以及脆弱的培養(yǎng)細胞,其物理和化學性質迥異,決定了不存在一種“萬能”的裂解方案。不恰當的方案可能導致蛋白質產量低下、特定類型的蛋白質(如膜蛋白、核蛋白)提取不完全、蛋白質被內源性蛋白酶降解,或產生與下游分析技術不兼容的裂解產物。
細胞裂解和蛋白質提取是研究細胞蛋白質的關鍵步驟,為蛋白質印跡、酶活性測定和質譜分析等眾多下游應用奠定了基礎。
一、通用裂解基礎原則
全程低溫:所有操作在冰上進行,裂解液預冷,防止蛋白降解。
2. 抑制劑及時添加:使用前新鮮加入蛋白酶抑制劑(PMSF、蛋白酶抑制劑 cocktail),研究磷酸化蛋白需加磷酸酶抑制劑(釩酸鈉、氟化鈉、β- 甘油磷酸鈉)。
3. 機械破碎輔助:組織樣本僅靠裂解液無法充分釋放蛋白,需配合研磨、超聲、勻漿儀等物理手段。
4. 裂解時間控制:冰上裂解 30~60 min,避免過長時間導致蛋白降解。
5. 離心澄清:裂解后 12000~14000 g,4℃離心 10~15 min,取上清即為總蛋白。
EnkiLife(恩璣生命)大分子蛋白專用細胞/組織裂解液(Cat#:RC0005):
? 完整抽提大分子蛋白質。
? 保護蛋白質翻譯后修飾(如磷酸化、糖基化、泛素化、甲基化和乙酰化)。
? 一步到位,無需添加酶抑制劑。
? 兼容細胞與組織樣本。
驗證數據: 樣本兼容性實驗

圖A:使用RC0005裂解 HeLa 細胞和小鼠大腦組織(各2組樣本),用mTOR (289 kDa)抗體對裂解物進行免疫印跡,裂解物上樣量為50μg。
圖B:使用RC0005裂解 HeLa 細胞和小鼠大腦組織(各2組樣本),用GAPDH(37kDa)抗體對裂解物進行免疫印跡,裂解物上樣量為50μg。
數據顯示RC0005對細胞樣本和組織樣本均有優(yōu)秀的裂解效果,同時兼容不同大小的蛋白樣本。
二、細胞樣本裂解
細胞樣本結構簡單,無細胞外基質阻礙,裂解難度最低,分為貼壁細胞與懸浮細胞兩類。
1.貼壁細胞樣本(HeLa、293T、腫瘤細胞等)
裂解液推薦
RIPA(強,完全裂解)或NP-40(溫和,保留復合物)
離心條件
12,000-14,000 rpm,4°C,15 min,收集上清
Tips
可直接在培養(yǎng)皿中裂解(加裂解液后刮?。?/div>
2. 懸浮細胞
樣本處理
離心收集(500-1000 rpm,5 min);PBS洗滌1-2次
裂解方式
冰上孵育30 min,期間每 10 min 用移液器反復吹打數次,確保細胞完全裂解
三、動物組織裂解
動物組織因細胞外基質豐富、組織致密程度差異極大,需根據組織特性選擇破碎方式與裂解液強度。核心原則:越致密、纖維越多的組織,機械破碎強度越高;酶活性越高的組織,抑制劑越要足量。
1. 腦組織
樣本特點
脂質含量極高(髓鞘豐富),蛋白豐度中等,內源蛋白酶活性中等,質地偏軟
樣本處理
新鮮取材后立即置于冰上;去除腦膜和血管;可分區(qū)(皮層、海馬、小腦等)
裂解液推薦
含 1% SDS 的強 RIPA 裂解液(增強膜蛋白溶解)
離心條件
12,000-14,000 rpm,4°C,15-20分鐘,取中間澄清層(避開上層脂質層和下層沉淀)
Tips
腦組織脂質多,離心后上層會有白色脂層,取樣時務必避開,否則會影響后續(xù) WB實驗
2. 肝臟組織
樣本特點
蛋白含量極高,內源蛋白酶、磷酸酶活性極強,質地松軟易破碎。
樣本處理
去除膽囊和結締組織;PBS 沖洗去除血液,濾紙吸干
裂解液推薦
常規(guī) RIPA + 雙倍劑量蛋白酶 / 磷酸酶抑制劑
裂解方式
冰上裂解 30 min,間歇渦旋2-3 次
離心條件
12,000-14,000 rpm,4°C,15分鐘,取上清
Tips
(1)肝臟蛋白酶活性極強,PMSF 需臨用前添加,且濃度提高至 2 mM。
(2)血液會干擾蛋白定量,務必用 PBS 充分灌流或沖洗干凈。
(3)肝臟蛋白濃度高,后續(xù)定量時需加大稀釋倍數。
3. 心臟/肌肉組織
樣本特點
肌纖維豐富、組織致密,機械強度高,普通勻漿難以充分破碎;線粒體蛋白豐富
離心條件
12,000-14,000 rpm,4°C,20分鐘
Tips
(1)液氮研磨是肌肉組織最有效的破碎方式,研磨不充分會導致得率極低。
(2)超聲避免產生泡沫,防止蛋白氧化變性。
4. 腎臟組織
樣本特點
血管網絡密集,血液殘留量大;皮質(腎小球、腎小管為主)與髓質蛋白表達譜差異顯著;組織質地偏韌,細胞外基質含量中等;內源蛋白酶、磷酸酶活性較強,且含大量膜轉運蛋白、離子通道與受體蛋白。
裂解液推薦
RIPA 裂解液(強);研究膜轉運蛋白可選用含 1% SDS 的增強型 RIPA
機械破碎
組織勻漿器勻漿直至無明顯肉眼可見固體;質地偏韌的樣本也可先液氮研磨成細粉,再加入裂解液重懸。
裂解方式
冰上裂解 30 min,每 10 min 渦旋混勻一次
離心條件
12,000 rpm,4°C,15-20 min,吸取中間澄清上清,棄去底層細胞碎片沉淀及表層少量脂膜。
Tips
(1)血液殘留是腎臟樣本最核心的干擾因素,會導致白蛋白、血紅蛋白等血液蛋白占比過高,掩蓋內源組織蛋白條帶,務必通過在體灌流或離體反復漂洗充分去除血液。
(2)腎臟皮質與髓質功能、蛋白譜差異極大,實驗設計需明確取材部位;常規(guī)總蛋白提取優(yōu)先選取腎皮質,目標蛋白豐度更高、結果更穩(wěn)定。
(3)腎臟內源磷酸酶活性較高,研究磷酸化修飾蛋白時,需新鮮配制并加入足量磷酸酶抑制劑,全程嚴格低溫操作,避免磷酸化信號衰減。
5. 脂肪組織
樣本特點
脂質占比極高,蛋白含量極低,常規(guī)方法得率差
樣本處理
去除血管和結締組織;盡量去除多余脂肪;PBS 沖洗,剪碎
裂解液推薦
含1-2% SDS的裂解液(脂質需高濃度去污劑)
離心條件
12,000 rpm,4°C,20 min,小心吸取下層水相蛋白溶液,完全棄去上層油脂。必要時用氯仿 - 甲醇法沉淀蛋白,去除殘留脂質
Tips
(1)肪組織蛋白得率低,需加大初始樣本量。
(2)離心后脂層與水相分界明顯,取樣時槍頭穿過脂層時避免帶入油脂。
(3)油脂殘留會導致 SDS-PAGE 電泳條帶彌散、泳道拖尾。
6. 脾臟
樣本特點
血竇系統(tǒng)高度發(fā)達,血液殘留量極大,紅細胞占比高;組織質地松軟,內源蛋白酶與核酸酶活性較強,易出現(xiàn)蛋白降解,血液蛋白易掩蓋內源組織蛋白信號。
樣本處理
脾臟用預冷 PBS 反復沖洗表面,輕柔擠壓排出血竇內殘血,有條件優(yōu)先采用心臟灌注取材以徹底去除血液
離心條件
12,000 rpm,4°C,15-20 min,吸取中間澄清蛋白上清,避開底層細胞碎片與紅細胞沉淀
Tips
(1)嚴控血液污染:灌注取材是最優(yōu)解決方案;若離心后上清仍偏紅,可再次低速離心去除殘留紅細胞。
(2)防范蛋白降解:免疫細胞內源蛋白酶活性高,取材后禁止室溫放置,需立即液氮速凍或全程冰上操作。
7. 腸道組織
樣本特點
(1)結構分層明顯,蛋白譜差異大;
(2)腔內雜質多,污染風險高;
(3)蛋白降解風險極高
樣本處理
按實驗需求截取對應腸段(十二指腸 / 空腸 / 回腸 / 結腸),縱向剪開,去除內容物;PBS輕柔沖洗;可分離黏膜/肌層
機械破碎
(1)黏膜層樣本:組織勻漿器勻漿直至無明顯肉眼可見固體。
(2)全層 / 肌層樣本:液氮中研磨成均勻細粉,再加入裂解液重懸。
裂解條件
冰上靜置裂解 30 min,每 10 min 輕渦旋混勻一次
離心條件
12,000 rpm,4°C,15分鐘,若上清仍渾濁黏稠,可重復離心一次,或經短暫超聲后再次離心。
Tips
(1)黏液干擾,需充分沖洗。
(2)蛋白酶活性高,腸道蛋白酶種類多、活性強,必須搭配廣譜蛋白酶抑制劑 cocktail,PMSF 終濃度可提高至 2 mM。
8. 血液
全血
含紅細胞、白細胞、血小板及血漿蛋白
(1)取 100-200 μL 全血,加入 2-3 倍體積 紅細胞裂解液(如 ACK 裂解液),室溫靜置 5-10 min,裂解紅細胞;
(2)4°C,300×g 離心 5 min,棄上清,保留白細胞沉淀;
(3)用預冷 PBS 洗滌白細胞沉淀 2 次;
(4)加入 RIPA 裂解液(含 1% 蛋白酶抑制劑),按 10? 細胞/100-200 μL 比例;
(5)冰上裂解 30 min,期間每 10 min 渦旋振蕩 1 次;
(6)4°C,12,000×g 離心 15-20 min,取上清即為蛋白提取液。
血清
去除血細胞和纖維蛋白原后的上清
新鮮全血室溫靜置 30~60 min 待充分凝血,3000 g、4℃離心 15 min,小心吸取上層淡黃色澄清血清,避免觸碰中間白細胞層與底層紅細胞。(直接稀釋使用,無需裂解)
血漿
含抗凝劑,保留纖維蛋白原
EDTA 抗凝全血顛倒混勻后,3000 g、4℃離心 15 min,取上層血漿。(直接稀釋使用,無需裂解)
血細胞(PBMC/白細胞)
需裂解紅細胞后分離
1. PBMC 分離(密度梯度離心法)
(1)新鮮 EDTA 抗凝血與等體積 PBS 稀釋混勻,沿管壁緩慢疊加到 Ficoll-Paque 分離液液面上方,保持界面清晰。
(2)2000 g、室溫離心 20 min(升降速調至最低,避免打破界面)。
(3)小心吸取中間乳白色的 PBMC 白膜層,轉移至新離心管,加入 5~10 倍體積預冷 PBS 重懸洗滌。
(4)1500 g、4℃離心 10 min,棄上清;重復洗滌 1~2 次,徹底去除殘留血小板與分離液。
2. 細胞裂解: 按每 1×10?細胞加入 100~200 μL 預冷裂解液,吹打重懸均勻,冰上裂解 30 min,每 10 min 輕渦旋一次。
3. 離心取上清: 14000 g、4℃離心 15 min,吸取中間澄清蛋白上清,棄底層細胞碎片沉淀。
四、植物組織裂解
植物樣本有堅韌的細胞壁,且富含多酚、多糖、次生代謝物,易導致蛋白氧化褐變、沉淀,是裂解難度最高的樣本類型。核心策略:液氮研磨破壁 + 多酚 / 多糖去除手段。且植物樣本極易氧化,建議裂解后1個月內使用完,未裂解的樣本,建議液氮保存長期保存,其次才考慮-80℃保存,注意-20℃保存不要超過1個月。
液氮研磨標準流程
收集
液氮蒸發(fā)后用預冷藥匙轉移粉末
粉末裝入含β-巰基乙醇的離心管
裂解
加入99:1裂解液 + 超聲破碎
無需額外勻漿步驟
離心
12,000-14,000 rpm離心15-20分鐘取上清
底部白色沉淀可冷凍保存?zhèn)溆?/div>
1. 葉片組織
樣本特點
細胞壁較薄,易研磨;葉綠體豐富,Rubisco(核酮糖二磷酸羧化酶)占比極高,易掩蓋低豐度蛋白;多酚含量中等
裂解液推薦
植物 RIPA + 1% PVP + 10 mM β- 巰基乙醇
離心條件
12,000-14,000 rpm,4°C,15-20分鐘,取上清;若上清仍有色素,可重復離心一次
Tips
(1)去除高豐度 Rubisco 可使用專門的植物蛋白富集試劑盒,提升低豐度蛋白檢測靈敏度。
(2)幼嫩葉片比老葉更容易提取,蛋白完整性更好。
(3)葉綠素等色素會干擾 BCA 定量,建議用 Bradford 法或 2-D 定量試劑盒。
2.根組織
樣本特點
纖維豐富,雜質多,多糖和次生代謝物含量高,易褐變;根表土壤易污染樣本
裂解液推薦
含 2% PVP、5% 甘油的裂解液,配合 TCA - 丙酮沉淀純化
Tips
(1)根系樣本雜質多,直接裂解的樣品雜質含量高,嚴重影響電泳質量,建議 TCA - 丙酮沉淀純化。
(2)幼根比老根蛋白含量高、木質化程度低,優(yōu)先選取根尖部位。
3.莖/枝干組織
樣本特點
木質化程度高,纖維多,細胞壁厚且堅硬,研磨難度大;蛋白含量低于葉片
Tips
(1)木質化莖稈務必充分研磨,肉眼看不到纖維顆粒才算合格。
(2)加熱輔助裂解可顯著提高蛋白得率,但不適用于需要保持蛋白天然活性的實驗。
4. 花
樣本特點
花是植物繁殖器官中結構異質性最強、次生代謝物干擾最嚴重的類型之一,核心裂解難點集中在褐變控制與低豐度蛋白富集
樣本處理
新鮮取材后立即置于冰上,根據實驗需求分離目標部位(如僅取花瓣、雄蕊或雌蕊),去除枯萎組織與表面雜質。用預冷蒸餾水快速沖洗 1 次,濾紙吸干表面水分,全程減少室溫暴露
蛋白裂解方法一
直接裂解法(適用于花蕊、花柄等褐變較輕的部位):
(1)按 1:5~1:8(質量:體積)加入預冷裂解液,快速渦旋混勻后立即置于冰上。
冰上裂解 30 min,每 10 min 輕渦旋混勻一次。
(2)14000 g、4℃離心 20 min,吸取中間澄清蛋白上清,棄去底部細胞碎片與表層色素漂浮層。
(3)若上清仍有明顯顏色,可加入少量 PVPP 吸附多酚,再次離心澄清。
蛋白裂解方法二
TCA - 丙酮沉淀法(花瓣等高色素樣本首選):
(1)研磨粉末轉移至預冷 EP 管,加入 3 倍體積的預冷 10% TCA - 丙酮溶液(含 0.07% β- 巰基乙醇),充分混勻。
(2)-20℃沉淀 2 h 以上(或過夜),期間顛倒混勻 1~2 次。
(3)12000 g、4℃離心 15 min,棄上清。· 用 80% 預冷丙酮洗滌沉淀 3 次,每次離心后徹底棄上清,去除殘留 TCA。
(4)室溫通風處風干 5~10 min 至無丙酮氣味(不可過度干燥,否則蛋白難以復溶)。
(5)加入適量裂解液渦旋重懸,冰上孵育 30 min 助溶。
(6)14000 g 離心 15 min,取上清即為純化后的蛋白樣品。
5. 種子
樣本特點
堅硬種皮破壁、高含量儲存雜質去除,以及內源酶活化導致的蛋白降解
樣本處理
根據實驗需求去除種皮,分離胚、胚乳等目標部位;蒸餾水快速沖洗表面灰塵,濾紙吸干水分。干燥種子直接液氮研磨,嚴禁浸泡水化,防止內源酶活化降解蛋白
裂解液推薦
1. 淀粉 / 蛋白類種子:含 2% SDS 的強裂解液或植物強 RIPA 裂解液;高純度需求搭配 TCA - 丙酮沉淀純化。
2. 油料種子:強 RIPA 裂解液,必須搭配正己烷 / 石油醚脫脂預處理。
蛋白裂解方法一
淀粉 / 蛋白類種子(水稻、小麥、豆類等):(1) 按 1:10(質量:體積)加入預冷裂解液,快速渦旋混勻,冰上裂解 30 min,每 10 min 渦旋一次。
(2) 14000 g、4℃離心 20 min,吸取中間澄清上清;若下層淀粉沉淀厚重,可重復離心一次去除殘留淀粉顆粒。
(3) 高純度實驗需求:研磨后直接用 10% TCA - 丙酮溶液沉淀蛋白,步驟同花組織沉淀法,可徹底去除淀粉、多糖與多酚雜質。
蛋白裂解方法二
油料種子(花生、油菜籽、芝麻等):
(1) 研磨粉末加入預冷正己烷(或石油醚),渦旋混勻后靜置 10 min,12000 g 離心 5 min 棄上清;重復脫脂 2~3 次。
(2) 通風處風干至無有機溶劑殘留(約 5 min),避免有機溶劑導致蛋白變性。
(3) 加入預冷強 RIPA 裂解液,渦旋混勻,冰上裂解 30 min。· 14000 g、4℃離心 20 min,小心吸取下層水相蛋白溶液,徹底避開表層殘留油脂。
五、RIPA裂解專屬關鍵注意事項(避坑重點)
1. 抑制劑必須現(xiàn)加:PMSF在水溶液中極易降解,必須臨用前加入RIPA,不可提前配制儲存。
3. 低溫操作:全程冰上/4℃操作,RIPA裂解過程產熱會導致蛋白降解、磷酸化位點丟失。
4. 樣本比例勿過量:組織/細胞過多、裂解液不足,會導致裂解不完全、蛋白濃度偏低、雜質過多。
5. 上清取用規(guī)范:離心后僅取清亮上清,堅決避免吸取油脂、沉淀,防止后續(xù)WB條帶雜帶、背景臟。
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