趙軍鋒教授一直致力于從有機(jī)化學(xué)到化學(xué)生物學(xué)的研究，主要的研究方向是多肽與蛋白質(zhì)的化學(xué)合成與修飾以及復(fù)雜多環(huán)分子的高效合成。期間，趙軍鋒教授發(fā)展了新的合成試劑，開(kāi)拓了諸多合成方法，并在基礎(chǔ)有機(jī)研究和多肽類(lèi)的合成中得到了廣泛的應(yīng)用，所在課題組的研究成果也受到了許多網(wǎng)絡(luò)媒體的關(guān)注。

2021年 多肽合成創(chuàng)新獎(jiǎng)（中國(guó)多肽產(chǎn)業(yè)聯(lián)盟） ; 2016年，趙軍鋒教授所在課題組在炔胺的氮上引入吸電子取代基合成了炔酰胺—Ynamides，相比于炔胺，Ynamides的熱、水穩(wěn)定性大大提高，同時(shí)由于引入了吸電子基團(tuán)， Ynamides本身堿性降低。作者利用Ynamides作為縮合劑，在不加其它添加劑的條件下，成功合成了一系列無(wú)外消旋化的多肽化合物。Ynamides合成簡(jiǎn)單，只需要兩步就能得到， 如下： ; 與現(xiàn)有的縮合劑相比，Ynamides作為縮合劑時(shí)，反應(yīng)的產(chǎn)率明顯提高。最重要是，在作者討論的底物中沒(méi)有發(fā)現(xiàn)有消旋化的發(fā)生。 ; 此外，在文獻(xiàn)條件下，即使當(dāng)氨基酸側(cè)鏈中含有-OH，-SH，-CONH2，NH時(shí)，反應(yīng)也能選擇性地發(fā)生，因此不需要額外對(duì)側(cè)鏈進(jìn)行保護(hù)。當(dāng)使用Val與Aib這些位阻較大取代 氨基酸作為底物時(shí)，只需要延長(zhǎng)反應(yīng)時(shí)間，也能以高收率得到目標(biāo)化合物，并且將反應(yīng)放大至20 mmol時(shí)，對(duì)收率也沒(méi)有太大的影響。此外，該方法也可以應(yīng)用于多肽片段之間的 縮合。綜上，Ynamides作為縮合劑具有極強(qiáng)的應(yīng)用性。

多肽合成創(chuàng)新獎(jiǎng)（中國(guó)多肽產(chǎn)業(yè)聯(lián)盟） ;多肽青年科學(xué)家獎(jiǎng)及英國(guó)皇家化學(xué)會(huì)會(huì)士 ;江西省百千萬(wàn)人才工程及萊佛士綠色制藥創(chuàng)新獎(jiǎng) ;“挑戰(zhàn)杯”創(chuàng)業(yè)計(jì)劃賽國(guó)家金獎(jiǎng)第一指導(dǎo)教師、第四屆中國(guó)互聯(lián)網(wǎng)+大賽國(guó)家銀獎(jiǎng)第一指導(dǎo)教師、人社部高層次留學(xué)人才回國(guó)資助計(jì)劃、第七屆中國(guó)僑界貢獻(xiàn)獎(jiǎng)及?Thieme Chemistry Journals Award ;洪堡學(xué)者獎(jiǎng)學(xué)金及Reaxys PhD Prize Finalist