背景[1-3]
改良布氏(BREWER)硫代羥乙酸鹽培養(yǎng)基用于厭氧菌和微需氧菌的培養(yǎng)。
成分:(g/L)Proteose Peptone 10.00;Infusion from Beef 17.50;Dextrose 5.00;Sodium Chloride 5.00;Dipotassium Phosphate 2.00;Sodium Thioglycollate 0.50;Methylene Blue 0.002;Agar 0.50。
厭氧菌(anaerobic bacteria)也叫厭氣菌。是一類在無氧條件下比在有氧環(huán)境中生長好的細(xì)菌,而不能在空氣(18%氧氣)和(或)10%二氧化碳濃度下的固體培養(yǎng)基表面生長的細(xì)菌。這類細(xì)菌缺乏完整的代謝酶體系,其能量代謝以無氧發(fā)酵的方式進(jìn)行。

改良布氏(BREWER)硫代羥乙酸鹽培養(yǎng)基
厭氧菌尚無公認(rèn)的確切定義,但通常認(rèn)為這是一類只能在低氧分壓的條件下生長,而不能在空氣(18%氧氣)和(或)10%二氧化碳濃度下的固體培養(yǎng)基表面生長的細(xì)菌。按其對氧的耐受程度的不同,可分為專性厭氧菌、微需氧厭氧菌和兼性厭氧菌。
根據(jù)對O?的耐受程度,可將厭氧菌分為三大類:
(1)對氧極端敏感的厭氧菌:代表菌種為月形單胞菌,這類細(xì)菌對厭氧條件要求很高,在空氣中暴露10min即死亡,臨床上很難分離出。
(2)中度厭氧菌:代表菌種為脆弱擬桿菌、產(chǎn)氣莢膜梭菌等臨床分離常見的厭氧菌。它們在空氣中暴露60~90min或在膿汁抽出72h后仍然能分離出來。
(3)耐氧厭氧菌:代表菌種為溶組織梭菌。這類細(xì)菌不能利用氧,在無氧條件下生長好,而在有氧條件下生長不佳。
應(yīng)用[4][5]
用于古井窖泥菌群中厭氧菌的純化培養(yǎng)與分子鑒定研究
利用厭氧培養(yǎng)、純培養(yǎng)技術(shù)以及16S全長高通量測序?qū)涯嘀械模▍捬酰┪⑸锶郝溥M(jìn)行分離鑒定及宏基因組測序,得到了窖泥中部分厭氧菌的名單,并將厭氧培養(yǎng)得到的純菌落名單與高通量測序名單進(jìn)行比較。
窖泥和酒醅以及酒醅-底層窖泥界面的黃水被用作制備培養(yǎng)基的主要部分,配以厭氧氣體在厭氧工作站對黃水及底層窖泥中的微生物進(jìn)行厭氧培養(yǎng),利用該方法可以得到大量厭氧菌落。
確定培養(yǎng)條件后,對不同質(zhì)量窖泥中的微生物進(jìn)行培養(yǎng),記錄多種形態(tài)學(xué)參數(shù),并進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分類。對代表性菌落進(jìn)行基因組DNA提取,全長16S r DNA擴(kuò)增和Sanger測序。結(jié)果證明,大多數(shù)菌落屬于梭菌和乳酸桿菌,但絕大多數(shù)測序的菌落無法查到詳細(xì)的分類信息。
利用16S全長高通量測序技術(shù),對打分結(jié)果有明顯差異的酒樣對應(yīng)的19個(gè)窖泥樣本進(jìn)行測序。得到窖泥中非常復(fù)雜的厭氧菌物種排名名單。
將不同質(zhì)量窖泥的優(yōu)勢菌群名單分別與厭氧培養(yǎng)分離測序結(jié)果進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)一些厭氧培養(yǎng)分離出的梭菌屬(Clostridium bornimense,Lactobacillus brevis)并未見于高通量測序結(jié)果中。即證明了高通量測序結(jié)果并不完全。鑒于厭氧培養(yǎng)并測序得到的菌種信息相對比較單一(只有梭菌和乳酸桿菌),這也說明窖泥中厭氧菌的培養(yǎng)方法還需進(jìn)一步深入研究。
參考文獻(xiàn)
[1]Combining culture-dependent and culture-independent molecular methods for the isolation and purification of a potentially novel anaerobic species from pit mud in a Chinese liquor distillery[J].Liu,Chaolan,Huang,Dan,Zhang,Wenxue Journal of the Institute of Brewing.2016,
[2]Identification and quantification of the caproic acid-producing bacterium Clostridium kluyveri in the fermentation of pit mud used for Chinese strong-aroma type liquor production[J].Hu,Xiao-long,Du,Hai,Xu,Yan International Journal of Food Microbiology.
[3]Difference of microbial community stressed in artificial pit muds for Luzhou-flavour liquor brewing revealed by multiphase culture-independent technology[J].Zhang,L.,Zhou,R.,Niu,M.,Journal of applied microbiology.
[4]Cultivable Fusobacterium species in chronic periodontitis microbiota identified with matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry[D].Kim,Ji Sun 2015
[5]韓穎.古井窖泥菌群中厭氧菌的純化培養(yǎng)與分子鑒定[D].哈爾濱工業(yè)大學(xué),2017