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T4RNALigase1的制備方法

2020/2/23 10:23:04

背景及概述[1]

連接酶是一種能催化兩個不同或相同分子的兩端相連接的酶,此反應(yīng)與ATP分解反應(yīng)相偶聯(lián)。T4RNALigase(T4RNA連接酶)是以不依賴于模板的形式催化供體核酸的5'-磷?;┒撕褪荏w核酸的3'-羥基末端形成磷酸二酯鍵。該酶活性依賴ATP,可作用于廣泛的底物,包括RNA,DNA,寡核糖核酸、寡脫氧核糖核酸和很多其它核酸衍生物。T4RNALigase主要用于RNA5´末端加寡聚核酸用于映射和測序5´端,或用于cDNA合成(RACE);用于3'-末端RNA標(biāo)記;用于連接RNA和DNA;用于修飾突變RNA。

制備方法[1]

T4RNALigase1可用于制備腺苷?;宇^,腺苷?;宇^能夠被截短型的T4RNA連接酶2特異性識別,在沒有ATP存在的條件下將腺苷?;宇^5’端有腺苷酰化修飾的磷酸與RNA的3’端的羥基連接,形成3,5-磷酸二酯鍵。

其制備方法包括:

(1)先合成一段寡核苷酸,寡核苷酸5’端磷酸化修飾,3’端進(jìn)行氨基修飾、雙脫氧胞嘧啶、磷酸修飾、熒光標(biāo)記修飾、倒轉(zhuǎn)堿基修飾或生物素標(biāo)記修飾中的一種;

(2)將步驟(1)的寡核苷酸在非截短型的T4RNALigase1催化下與ATP反應(yīng),獲得腺苷?;宇^。

本申請的制備方法,打破傳統(tǒng)化學(xué)合成腺苷?;宇^的思維限制,先合成寡核苷酸,T4RNALigase1將ATP分解成AMP,AMP轉(zhuǎn)移到磷酸上,形成腺苷?;捎?’端修飾,寡核苷酸保持在腺苷?;虚g態(tài),從而制備出腺苷酰化接頭。本申請的制備方法成本低、效率高,能滿足使用需求,有效的降低了RNA高通量測序的成本。

參考資料

[1] CN201410391721.X一種制備腺苷?;宇^的方法及腺苷?;宇^

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