蛋白質(zhì)測定儀分析蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)
盡管實(shí)驗(yàn)技術(shù)不斷得到改進(jìn)，但通過實(shí)驗(yàn)確定的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和己知序列之間的差距仍在不斷增大。顯然，所有蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)都通過實(shí)驗(yàn)來測定是不現(xiàn)實(shí)的，蛋白質(zhì)三維空間結(jié)構(gòu)測定的速度遠(yuǎn)遠(yuǎn)不能滿足研究與應(yīng)用的需求。因此，利用生物信息學(xué)知識，發(fā)展一種可靠的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測方法已成為一項(xiàng)迫切的任務(wù)，蛋白質(zhì)含量的測定可以使用蛋白質(zhì)測定儀進(jìn)行測定分析
.無同源信息的蛋白質(zhì)預(yù)測困難:到目前為止大多數(shù)二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測方法都是基于已知的家族蛋白質(zhì)進(jìn)行的，但是還有很多的未知蛋白可能不屬于任何己知的蛋白質(zhì)家族。對于這些低同源和無同源蛋白質(zhì)的靶蛋白，利用傳統(tǒng)的同源預(yù)測法進(jìn)行二級結(jié)構(gòu)預(yù)測是非常困難的，蛋白質(zhì)的測定可以使用定氮儀進(jìn)行快速的測定分析。
蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測的最終目標(biāo)是為了能更好地進(jìn)行三級結(jié)構(gòu)和功能預(yù)測。如果二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測準(zhǔn)確率如果達(dá)到80%的話，我們就可以基本準(zhǔn)確地預(yù)測蛋白質(zhì)分子的三維空間結(jié)構(gòu)。因此，進(jìn)一步提高蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測的精度是當(dāng)務(wù)之急。但在上個(gè)世紀(jì)60年代到90年代間，蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測只能達(dá)到60%左右。一直到1993年在算法和模型上進(jìn)行改進(jìn)儀0]，將蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測準(zhǔn)確率提高了將近7%，終于使蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測準(zhǔn)確率突破70%。然而到目前為止的研究中，預(yù)測準(zhǔn)確率一直在75%左右，無法取得進(jìn)一步突破。影響預(yù)測準(zhǔn)確率提高的因素有多種，首先是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的形成機(jī)理，人類對蛋白質(zhì)中機(jī)制尚未完全認(rèn)識清楚，以至于不能建立的預(yù)測模型
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