乳雙歧桿菌HN019探針?lè)晒舛縋CR試劑盒
商品屬性
產(chǎn)品名稱 | 乳雙歧桿菌HN019探針?lè)晒舛縋CR試劑盒 | 英文名稱 | Bifidobacterium lactis HN019 Probe-based Fluorescent Quantitative PCR Kit |
規(guī)格 | 50T | 貨號(hào) | PR4655 |
預(yù)期用途
本試劑盒采用TaqMan探針?lè)晒舛縋CR(qPCR)技術(shù),用于特異性檢測(cè)樣品中乳雙歧桿菌(Bifidobacterium animalis subsp. lactis)HN019菌株的DNA。適用于食品、保健品、藥品、發(fā)酵制品、糞便樣本、環(huán)境樣本等中HN019菌株的定性和定量分析(需配合標(biāo)準(zhǔn)品)。
檢測(cè)原理
本試劑盒基于實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),利用特異性引物擴(kuò)增乳雙歧桿菌HN019菌株的靶基因片段(通常為菌株特異性基因或SNP位點(diǎn)區(qū)域)。反應(yīng)體系中包含一條與擴(kuò)增片段內(nèi)部序列特異性結(jié)合的熒光標(biāo)記探針(通常為TaqMan探針)。探針5'端標(biāo)記報(bào)告熒光基團(tuán)(如FAM),3'端標(biāo)記淬滅熒光基團(tuán)(如BHQ1)。當(dāng)探針完整時(shí),報(bào)告基團(tuán)發(fā)出的熒光被淬滅基團(tuán)吸收。在PCR擴(kuò)增過(guò)程中,Taq DNA聚合酶的5'→3'外切酶活性會(huì)將探針?biāo)猓箞?bào)告熒光基團(tuán)與淬滅熒光基團(tuán)分離,從而釋放熒光信號(hào)。熒光信號(hào)的強(qiáng)度與每個(gè)循環(huán)中擴(kuò)增產(chǎn)物的數(shù)量成正比,通過(guò)監(jiān)測(cè)熒光信號(hào)的增長(zhǎng),即可實(shí)現(xiàn)對(duì)起始模板DNA的定量檢測(cè)。
主要組分
qPCR預(yù)混液 (2X): 包含優(yōu)化的緩沖液、dNTPs、熱啟動(dòng)Taq DNA聚合酶、Mg2?等??赡馨琑OX等被動(dòng)參比染料(取決于儀器需求)。
乳雙歧桿菌HN019特異性引物探針混合液: 包含針對(duì)HN019菌株設(shè)計(jì)的特異性正向引物、反向引物和熒光標(biāo)記探針(如FAM/BHQ1標(biāo)記)。濃度已優(yōu)化。
無(wú)核酸酶水: 用于稀釋和配制反應(yīng)體系。
陽(yáng)性對(duì)照 (Positive Control): 含有已知濃度的乳雙歧桿菌HN019基因組DNA片段或質(zhì)粒DNA。
陰性對(duì)照 (Negative Control): 無(wú)核酸酶水或不含目標(biāo)DNA的緩沖液。
需要自備的材料與設(shè)備
實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(支持FAM通道,如ABI 7500, QuantStudio系列, Bio-Rad CFX系列, Roche LightCycler系列等)。
微量移液器(0.5-10μL, 10-100μL, 20-200μL)及配套無(wú)菌、無(wú)核酸酶吸頭。
無(wú)菌、無(wú)核酸酶的PCR反應(yīng)管或96孔/384孔PCR板。
渦旋混合器。
微型離心機(jī)。
冰盒。
生物安全柜或超凈工作臺(tái)(推薦用于樣品處理)。
DNA提取試劑盒: 用于從樣品中提取基因組DNA(需自備,推薦使用針對(duì)細(xì)菌或糞便樣本的DNA提取試劑盒)。
用于制備標(biāo)準(zhǔn)曲線的標(biāo)準(zhǔn)品(可選,如需絕對(duì)定量,需自備或使用試劑盒可能提供的標(biāo)準(zhǔn)品)。
樣品DNA制備
使用合適的商業(yè)DNA提取試劑盒,按照其說(shuō)明書(shū)操作,從待測(cè)樣品(如益生菌產(chǎn)品、糞便、發(fā)酵液等)中提取基因組DNA。
提取的DNA應(yīng)盡快進(jìn)行qPCR檢測(cè),或分裝后于-20°C或-80°C保存。
建議使用分光光度計(jì)(如NanoDrop)或熒光染料法(如Qubit)測(cè)定DNA濃度和純度(OD260/OD280應(yīng)在1.8-2.0之間)。注意: 對(duì)于復(fù)雜樣本(如糞便),雜質(zhì)可能影響定量準(zhǔn)確性,PCR抑制物檢測(cè)是必要的(可選做)。
操作步驟
試劑準(zhǔn)備與解凍: 取出試劑盒各組分,在室溫下完全解凍(除酶外),短暫離心后置于冰上備用。qPCR預(yù)混液解凍后需充分混勻。
反應(yīng)體系配制(以20μL體系為例,在冰上操作):
qPCR預(yù)混液 (2X): 10 μL
乳雙歧桿菌HN019引物探針混合液: 2 μL
模板DNA: 2-5 μL (建議加入量對(duì)應(yīng)DNA濃度在1-100 ng/μL范圍內(nèi),或根據(jù)預(yù)實(shí)驗(yàn)優(yōu)化)
無(wú)核酸酶水: 補(bǔ)足至 20 μL
示例總量: 20 μL
注意: 模板加入體積和濃度需優(yōu)化,避免抑制劑干擾或濃度過(guò)高導(dǎo)致抑制。每個(gè)樣本建議設(shè)置復(fù)孔。
對(duì)照設(shè)置:
陽(yáng)性對(duì)照孔: 用陽(yáng)性對(duì)照DNA代替模板DNA。
陰性對(duì)照孔 (NTC): 用等體積無(wú)核酸酶水代替模板DNA。
樣品陰性對(duì)照 (可選): 使用確認(rèn)為不含HN019的同類樣品DNA。
混勻與離心: 輕輕渦旋或移液器吹打混勻各反應(yīng)管/孔,避免產(chǎn)生氣泡。短暫離心收集管壁液滴。
上機(jī)運(yùn)行: 將反應(yīng)管/板放入qPCR儀中,按照以下推薦的循環(huán)程序設(shè)置運(yùn)行:
預(yù)變性: 95°C, 3-5分鐘 (激活熱啟動(dòng)酶)
循環(huán)擴(kuò)增 (40-45個(gè)循環(huán)):
變性: 95°C, 10-15秒
退火/延伸: 60°C, 30-60秒 (此步采集FAM通道熒光信號(hào) - 關(guān)鍵步驟)
注:退火溫度和時(shí)間需根據(jù)實(shí)際引物探針設(shè)計(jì)優(yōu)化,通常說(shuō)明書(shū)會(huì)明確給出。
數(shù)據(jù)分析: 運(yùn)行結(jié)束后,儀器軟件會(huì)自動(dòng)生成擴(kuò)增曲線和Ct (Threshold Cycle) 值。
設(shè)定閾值 (Threshold): 通常在指數(shù)擴(kuò)增期的上方,手動(dòng)或自動(dòng)設(shè)置,確保所有分析使用同一閾值。
設(shè)定基線 (Baseline): 通常是前3-15個(gè)循環(huán)的背景熒光。
注意事項(xiàng)
污染控制: qPCR極其靈敏,必須嚴(yán)格分區(qū)操作(樣品準(zhǔn)備區(qū)、試劑配制區(qū)、擴(kuò)增及產(chǎn)物分析區(qū)),使用帶濾芯吸頭,勤換手套,定期清潔臺(tái)面和儀器,避免氣溶膠污染。嚴(yán)禁將PCR產(chǎn)物帶入前區(qū)。
試劑保存: -20℃避光保存。避免反復(fù)凍融,建議分裝使用。使用前請(qǐng)充分混勻。解凍后在冰上操作。
模板要求: DNA樣品應(yīng)無(wú)降解,避免含有PCR抑制劑(如酚、氯仿、EDTA、肝素、腐殖酸、某些金屬離子、高濃度鹽等)。建議使用已知抑制物檢測(cè)試劑盒驗(yàn)證或進(jìn)行適當(dāng)稀釋。
反應(yīng)體系優(yōu)化: 首次使用或更換不同來(lái)源樣品時(shí),建議對(duì)模板加入量進(jìn)行優(yōu)化(如測(cè)試不同稀釋倍數(shù))。
儀器校準(zhǔn): 定期對(duì)qPCR儀進(jìn)行光學(xué)校準(zhǔn)和背景校準(zhǔn)。
結(jié)果解釋: qPCR檢測(cè)的是特定DNA片段的存在,不能直接等同于活性菌的數(shù)量。樣品中可能存在死菌或游離DNA。定量結(jié)果需結(jié)合DNA提取效率、樣品類型等因素綜合判斷。
生物安全: 陽(yáng)性對(duì)照可能含有DNA片段,需按生物廢棄物處理。
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關(guān)鍵字: 乳雙歧桿菌HN019;染料法熒光定量;PCR試劑盒;
派瑞曼pyram?是上海博湖生物科技有限公司(Shanghai Bohu Biological Technology Co., Ltd.,China)的產(chǎn)品品牌。
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