英文名稱:rCRAMP(10-43) peptide (Murine Cathelicidin-Related Antimicrobial Peptide, residues 10-43)
單字母多肽序列:GLLRKGGEKFGEKLRKIGQKIKDFFQKLAPEIEQ
中文名稱:小鼠Cathelicidin相關(guān)抗菌肽(第10-43位氨基酸片段)
等電點:理論估算值 > 11.0。該片段保留了完整rCRAMP中幾乎所有的堿性氨基酸(精氨酸、賴氨酸),凈正電荷極高,呈強堿性。
其他特性:此肽段是完整rCRAMP(37肽)的一個N端截短變體。它去除了完整序列N端前9個氨基酸(RFKKISRLR),因此可能改變了肽的整體兩親性平衡和電荷分布,影響其與細(xì)胞膜及特定受體的相互作用模式。
構(gòu)效關(guān)系研究:作為N端截短的rCRAMP變體,用于研究與完整rCRAMP及人源LL-37在活性、穩(wěn)定性、受體親和力等方面的差異,從而定位其功能關(guān)鍵域。
選擇性機(jī)制探究:可能用于探索rCRAMP對不同靶細(xì)胞(如細(xì)菌、哺乳動物細(xì)胞、特定免疫細(xì)胞)的選擇性機(jī)制。N端截短可能降低或改變其對某些靶標(biāo)的活性。
工具肽開發(fā):可作為研究Cathelicidin家族肽的亞片段功能的工具,例如用于探究其促細(xì)胞遷移、血管生成或免疫調(diào)節(jié)活性是否集中于C端區(qū)域。
藥物化學(xué)優(yōu)化模型:為設(shè)計更小、更具靶向性的抗菌肽或組織修復(fù)肽提供結(jié)構(gòu)簡化模型。
其應(yīng)用原理在于作為一種 “功能域缺失對照”或“結(jié)構(gòu)簡化探針”:
對比參照:通過與完整rCRAMP在相同實驗條件下的直接比較,可以評估N端前9個氨基酸序列(特別是富含正電荷和疏水性殘基的區(qū)域)對肽的整體生物活性(抗菌、趨化、促修復(fù)等)的貢獻(xiàn)。
功能分離:可能幫助分離或鑒定出rCRAMP中負(fù)責(zé)特定功能的獨立結(jié)構(gòu)域,例如,如果此片段保留了促遷移活性但喪失了直接抗菌活性,則表明兩種功能可由不同區(qū)域介導(dǎo)。
研發(fā)定位:主要作為基礎(chǔ)研究中的工具分子和先導(dǎo)化合物優(yōu)化過程中的中間體。
識別最小活性單元:有助于確定產(chǎn)生特定生物學(xué)效應(yīng)所需的最小肽段序列,為開發(fā)成本更低、合成更簡便的肽類藥物奠定基礎(chǔ)。
降低潛在毒性:N端截短可能減少非特異性膜破壞作用,從而可能降低對宿主細(xì)胞的毒性,提高治療指數(shù)。
活性評估:需要系統(tǒng)評估其相對于完整肽的活性變化。其抗菌譜、效價和免疫調(diào)節(jié)功能可能發(fā)生顯著改變。
穩(wěn)定性:作為線性肽,仍需面對蛋白酶降解的問題,但結(jié)構(gòu)簡化可能為后續(xù)引入穩(wěn)定化修飾(如環(huán)化)提供更清晰的起點。
其作用機(jī)理需通過實驗與完整rCRAMP對比來闡明,可能呈現(xiàn)以下特點:
膜相互作用改變:去除了N端帶正電荷的“FRKK”等序列,可能降低其與帶負(fù)電細(xì)菌膜的最初靜電吸引速率或結(jié)合親和力,從而影響其膜破壞效率。
受體信號偏好性偏移:N端序列可能參與特定受體(如甲酰肽受體2或EGFR)的結(jié)合或激活。截短后可能減弱或消除某些信號通路,同時可能更凸顯由核心螺旋區(qū)域介導(dǎo)的其他通路。
細(xì)胞選擇性可能變化:由于電荷和疏水性平衡的改變,其對不同細(xì)胞類型(如細(xì)菌 vs. 哺乳動物細(xì)胞)的穿透性和破壞閾值可能發(fā)生變化。
基礎(chǔ)研究工具:對rCRAMP及其片段的研究主要集中于理解其結(jié)構(gòu)-功能關(guān)系。截短變體如rCRAMP(10-43)是常用的實驗工具。
有限的特異性報道:相較于完整的rCRAMP,該片段的研究和公開數(shù)據(jù)較少。其具體功能譜需要結(jié)合具體實驗設(shè)計來闡明。
價值在于比較:其主要科學(xué)價值不在于單獨應(yīng)用,而在于作為對照物,幫助揭示完整rCRAMP中N端區(qū)域的功能重要性。
完整rCRAMP:這是最直接的對照。任何關(guān)于rCRAMP(10-43)功能的結(jié)論都必須通過與完整分子的比較得出。
人源LL-37及其片段:例如,LL-37(17-29) 等片段被廣泛研究,發(fā)現(xiàn)其可能具有與完整LL-37不同的或更特異性的活性(如強促血管生成但弱抗菌)。rCRAMP(10-43)的研究遵循類似的邏輯,旨在解碼小鼠Cathelicidin的功能圖譜。
其他抗菌肽的截短類似物:如蛙皮抗菌肽Magainin 2的截短變體,研究顯示核心螺旋區(qū)域足以維持部分抗菌活性。這為rCRAMP(10-43)可能保留某些功能提供了類比依據(jù)。
功能域研究通用策略:在蛋白質(zhì)和肽科學(xué)中,通過生成一系列N端或C端截短突變體來定位活性核心,是一種經(jīng)典方法。rCRAMP(10-43)正是這種方法在小鼠Cathelicidin研究中的應(yīng)用實例。
Asp-Pro-Ala-Phe-Ser-Ser-Trp-Gly-NH2
Gly-Ala-Asp-Phe-Tyr-Ser-Trp-Gly-NH2
Pyr-Asp-Val-Asp-His-Val-Phe-Leu-Arg-Phe-NH2
Pyr-Thr-Ser-Phe-Thr-Pro-Arg-Leu-NH2
Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-Arg-Arg
Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-Arg-Phe
所有產(chǎn)品僅用作實驗室科學(xué)研究,不為任何個人用途提供產(chǎn)品和服務(wù)。
關(guān)鍵字: 多肽合成;多肽合成公司;多肽合成定制;多肽定制公司;多肽定制廠家;
強耀生物是一家集多肽合成定制,抗體制備,蛋白表達(dá)的研發(fā)、生產(chǎn)、銷售 為一體,主要產(chǎn)品有促皮質(zhì)素 (ACTH),血管舒緩激肽,促胰島素分泌肽,Peptides YY,Amylin, 促甲狀腺釋放 激素及相關(guān)肽,多克隆抗體,單克隆抗體等及原核蛋白表達(dá),酵母蛋白表達(dá),細(xì)胞蛋白表達(dá)等。