CNV，即拷貝數(shù)變異(Copy number variation, CNV),是由基因組發(fā)生重排而導(dǎo)致的, 一般指長(zhǎng)度為 1 kb 以上的基因組大片段的拷貝數(shù)增加或者減少，主要表現(xiàn)為亞顯微水平的缺失和重復(fù)。基因拷貝數(shù)多態(tài)(CNV)是造成個(gè)體差異的重要遺傳基礎(chǔ)，它在人類基因組中分布廣泛, 其覆蓋的核苷酸總數(shù)大大超過(guò)單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)的總數(shù), 極大地豐富了基因組遺傳變異的多樣性。CNV對(duì)于物種特異的基因組構(gòu)成、物種的演化和系統(tǒng)發(fā)育以及基因組某些特定區(qū)域基因的表達(dá)和調(diào)控可能具有非常重要的生物學(xué)意義。因此，CNV也是近來(lái)基因組學(xué)的研究熱點(diǎn)，并且異常的DNA拷貝數(shù)變化（CNV）是許多人類疾?。ㄈ绨┌Y、遺傳性疾病、心血管疾病）的一種重要分子機(jī)制。作為疾病的一項(xiàng)生物標(biāo)志，染色體水平的缺失、擴(kuò)增等變化已成為許多疾病研究的熱點(diǎn)。

目前，拷貝數(shù)目變異(CNV)的研究主要集中在人類基因組，研究?jī)?nèi)容包括在全基因組范圍內(nèi)CNV多態(tài)性的檢測(cè)，基因組某個(gè)特定區(qū)域CNV的多態(tài)性與某種復(fù)雜疾病及疾病易感性的關(guān)聯(lián)分析以及CNV的進(jìn)化等。

    CNV在基因組中的存在形式主要有5種：2條同源染色體同時(shí)出現(xiàn)缺失； 1條同源染色體發(fā)生缺失，另1條正常；1條同源染色體出現(xiàn)拷貝數(shù)重復(fù)，另l條正常；1條同源染色體出現(xiàn)缺失，另1條出現(xiàn)拷貝數(shù)重復(fù)；2條同源染色體同時(shí)出現(xiàn)拷貝數(shù)重復(fù)。

檢測(cè)方法

1. 比較基因組雜交芯片是目前檢測(cè)CNV多態(tài)性最常用的方法，隨著人類基因組測(cè)序工作順利進(jìn)行 ,BAC文庫(kù)、cDNA文庫(kù)和Contig.文庫(kù)在公共數(shù)據(jù)庫(kù)中大量積累, 使得把芯片技術(shù)運(yùn)用于比較基因組雜交成為可能，比較基因組雜交芯片反映的圖譜清晰度主要由陣列的探針長(zhǎng)度和點(diǎn)樣數(shù)目決定。近年來(lái), 該技術(shù)的發(fā)展主要集中在陣列的點(diǎn)樣數(shù)目越來(lái)越多, 探針長(zhǎng)度越來(lái)越短。

2. SNP芯片是另一種有效檢測(cè)CNV的技術(shù)，比較基因組雜交芯片不同的是, SNP芯片不需要同時(shí)使用兩個(gè)樣本的DNA(實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組)和探針進(jìn)行雙雜交, 只需單雜交即可完成；

3. 基于不同個(gè)體的DNA序列比對(duì)是檢測(cè)CNV的最直接的方法，這種方法的優(yōu)勢(shì)是圖譜的清晰度可以達(dá)到單核苷酸水平。但由于測(cè)序費(fèi)用的昂貴,要對(duì)一個(gè)群體的多個(gè)個(gè)體進(jìn)行基因組測(cè)序還不現(xiàn)實(shí)；

4. 定量PCR也可用于CNV的檢測(cè)，可用TaqMan探針,利用熒光定量PCR進(jìn)行CNV的檢測(cè)。

    目前已有超過(guò)160萬(wàn)個(gè)專為基因組拷貝數(shù)變異或更小的基因組區(qū)域變異檢測(cè)而優(yōu)化設(shè)計(jì)的TaqMan CNV預(yù)制試劑盒，利用本公司高通量實(shí)時(shí)定量PCR平臺(tái)，可對(duì)多檢測(cè)樣本進(jìn)行多目標(biāo)基因（具有拷貝數(shù)多態(tài)）以及參照基因（沒(méi)有拷貝數(shù)多態(tài)）拷貝數(shù)定量分析，通過(guò)計(jì)算兩個(gè)檢測(cè)值的比值可以分析樣本的候選基因的拷貝數(shù)。

技術(shù)特點(diǎn)

· 采用的是具有高度特異性和高重復(fù)性的ABI TaqManCNV試劑盒。

· 采用聲波移液的技術(shù)，能夠進(jìn)行高通量，快速全自動(dòng)加樣，均一性高，反應(yīng)體系小，最小能達(dá)到2ul反應(yīng)體系，節(jié)約成本。

· 最多能夠同時(shí)進(jìn)行380種樣品的目的基因檢測(cè)，或者是單一樣品的380種基因的檢測(cè)。