1557136-25-0
中文名稱
CY5.5-疊氮
英文名稱
1H-Benz[e]indolium, 2-[5-[3-[6-[(3-azidopropyl)amino]-6-oxohexyl]-1,3-dihydro-1,1-dimethyl-2H-benz[e]indol-2-ylidene]-1,3-pentadien-1-yl]-1,1,3-trimethyl-, chloride (1:1)
CAS
1557136-25-0
分子式
C43H49N6O.Cl
分子量
701.34
MOL 文件
1557136-25-0.mol
1557136-25-0 結(jié)構(gòu)式
基本信息
英文別名
1H-Benz[e]indolium, 2-[5-[3-[6-[(3-azidopropyl)amino]-6-oxohexyl]-1,3-dihydro-1,1-dimethyl-2H-benz[e]indol-2-ylidene]-1,3-pentadien-1-yl]-1,1,3-trimethyl-, chloride (1:1) 所屬類別
材料化學(xué)：發(fā)光材料物理化學(xué)性質(zhì)
外觀性狀外觀 : 深藍(lán)色固體
ex/em : 680/698 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 198000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.20
ex/em : 680/698 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 198000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.20
溶解度Soluble in DMSO, DMF, DCM
形態(tài)Solid
顏色Pink to red
外觀Dark blue solid
ε(消光系數(shù))198000 L?mol?1?cm?1
Φ(量子產(chǎn)率)0.20
激發(fā)峰(Ex)/發(fā)射峰(Em)680/698 nm (PBS buffer)
常見(jiàn)問(wèn)題列表
概述
CY5.5-疊氮 是一種有效的熒光染料。Cyanine 5.5 azide 可以標(biāo)記 DNA。Cyanine 5.5 azide 可用于近紅外活體成像。(λex=684 nm, λem=710 nm)。Cyanine 5.5 azide 是一種點(diǎn)擊化學(xué)試劑。它含有 Azide 基團(tuán)，可以和含有 Alkyne 基團(tuán)的分子發(fā)生銅催化的疊氮-炔環(huán)加成反應(yīng)（CuAAc)。它還可以和含有 DBCO 或 BCN 基團(tuán)的分子發(fā)生環(huán)張力驅(qū)動(dòng)的炔-疊氮環(huán)加成反應(yīng) (SPAAC)。熒光標(biāo)記染料
Cy5.5 (Cyanine 5.5) 是一種發(fā)近紅外（NIR）熒光的花青素?zé)晒馊玖?。它的消光系?shù)高，熒光也很亮，并且對(duì)pH不敏感，并且由于它的熒光波長(zhǎng)（Em：~700nm）恰好處于肌體組織近紅外窗口 I 的區(qū)域（肌體的血液，體液和組織此區(qū)域背景熒光弱，而長(zhǎng)波長(zhǎng)穿透性強(qiáng)），所以Cy5.5常應(yīng)用于小動(dòng)物活體體內(nèi)成像中。 Cy5.5可以用來(lái)標(biāo)記蛋白，抗體，多肽，納米粒等，它最常見(jiàn)的使用是標(biāo)記核酸分子（DNA和RNA）。疊氮(azide)是常用生物標(biāo)記基團(tuán)。通過(guò)點(diǎn)擊化學(xué)反應(yīng)(click chemistry)，疊氮可以和一系列炔烴(alkyne)或環(huán)炔烴(strained alkyne)生成穩(wěn)定的生物鏈接(bioconjugate)。點(diǎn)擊化學(xué)反應(yīng)效率很高，可在水相中(也可有機(jī)相)快速定量完成(幾乎100%產(chǎn)率)，即使在低濃度(μM)和低溫(4oC)下也可完成。點(diǎn)擊化學(xué)反應(yīng)技術(shù)發(fā)展很成熟，各種相關(guān)試劑商業(yè)可得，各種生物標(biāo)記應(yīng)用廣泛。
Cy5.5標(biāo)記后的產(chǎn)物Ex/Em是680/698nm。和它具有相似熒光特性的染料包括Alexa Fluor 680，DyLight 680等。
注意事項(xiàng)
- Cy5.5-疊氮水溶性較低，如需在水相中標(biāo)記可選擇磺化Cy5.5-疊氮。
- 疊氮化合物可被強(qiáng)還原劑(如DTT)還原破壞，使用時(shí)務(wù)必去除還原劑。
- 標(biāo)記反應(yīng)不要放在強(qiáng)光下，因?yàn)榇蟛糠譄晒饣衔镌趶?qiáng)光下長(zhǎng)時(shí)間照射會(huì)緩慢光漂泊(photobleaching)。