背景及概述[1]
尿嘧啶DNA糖基酶(Uracil-DNA Glycosylase ,UDG)來(lái)源于大腸桿菌重組克隆表達(dá)。分子量為25kDa,水解尿嘧啶和糖基之間的 N-糖基鍵,在含尿嘧啶的單鏈或雙鏈 DNA 中產(chǎn)生脫嘧啶的位點(diǎn),可催化含尿嘧啶的單鏈和雙鏈DNA釋放游離尿嘧啶。它對(duì)RNA無(wú)活性,主要應(yīng)用于防止PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的污染。如將PCR核酸擴(kuò)增的高靈敏度和膠體金免疫層析技術(shù)快速、簡(jiǎn)便、直觀的優(yōu)點(diǎn)結(jié)合起來(lái),建立了同時(shí)檢測(cè)2種對(duì)蝦病毒(WSSV和IHHNV)的同步PCR-膠體金免疫層析檢測(cè)方法,在PCR過(guò)程中使用UNG(尿嘧啶-DNA糖基酶),極大地控制了遺留污染。該酶作用機(jī)理為:在PCR反應(yīng)中以dUTP代替dTTP,擴(kuò)增產(chǎn)物片段中的T全部被U取代,形成了含dU堿基的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。UNG酶能選擇性斷裂單鏈和雙鏈DNA中U堿基的糖苷鍵,降解反應(yīng)體系中含U的DNA,有效消除PCR產(chǎn)物的殘留污染,大大降低擴(kuò)增產(chǎn)物污染導(dǎo)致的假陽(yáng)性,從而保證擴(kuò)增的特異性和準(zhǔn)確性。

單位定義[1]
在 37°C,60 分鐘內(nèi)從含有尿嘧啶的 DNA 模板中釋放 1 nmol 尿嘧啶所需要的酶量定義為 1 U。
10×Reaction Buffer
200 mM Tris-HCl (pH 8.2, 25°C), 10 mM EDTA, 100 mM NaCl.
保存緩沖液[1]
30 mM HEPES-KOH (pH7.5), 150 mM NaCl, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% (v/v) Tween 20, 50% (v/v) 甘油。
質(zhì)量控制[1]
無(wú)內(nèi)切或外切脫氧核糖核酸酶、核糖核酸酶、磷酸酶污染。
用途[1]
PCR 交叉污染控制;
糖激酶介導(dǎo)的單核苷酸多態(tài)性檢測(cè)(GMPD);
位點(diǎn)特異性突變;
蛋白-DNA 相關(guān)作用研究用探針;
SNP 基因分型;
PCR 產(chǎn)物克??;
PCR 產(chǎn)物和 cDNA 中產(chǎn)生單鏈突出末端。
抑制和失活
抑制劑:Baccillus subtilis 噬菌體 PBS2 來(lái)源的 Ugi 蛋白;Baccillus subtilis 噬菌體 phi29來(lái)源的 p56 蛋白。
失活:95°C 加熱 10 分鐘。當(dāng)溫度低于 55°C時(shí),酶活性部分還原。因此 PCR 擴(kuò)增后,PCR 產(chǎn)物冰浴后可直接上樣凝膠電泳。
備注
Uracil-DNA Glycosylase在DNA中產(chǎn)生無(wú)堿基位點(diǎn),加熱、堿處理、內(nèi)切核酸酶(特異性切割無(wú)堿基位點(diǎn))可在該無(wú)堿基位點(diǎn)切割。UDG 發(fā)揮活性不受二價(jià)陽(yáng)離子影響。
主要參考文獻(xiàn)
[1] 丁東, 熊云, 方勇新, 等. WSSV 和 IHHNV 對(duì)蝦病毒的膠體金免疫層析快速檢測(cè)[J]. 水產(chǎn)養(yǎng)殖, 2014, 35(10): 1-7.