乳腺癌是全球女性中發(fā)病率最高的惡性腫瘤,約占新增癌癥病例的 11.6%,死亡率達 6.9%,嚴重威脅女性健康。盡管早期診斷和治療技術不斷進步,但仍有部分患者會出現(xiàn)疾病進展和遠處轉移,其潛在分子機制尚未完全闡明。環(huán)狀RNA(circRNAs)作為一類具有閉合環(huán)狀結構的非編碼 RNA,在腫瘤發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著miRNA海綿、結合 RNA 結合蛋白、編碼多肽等多種生物學功能,已成為腫瘤研究的熱點方向。腫瘤相關巨噬細胞(TAMs)作為腫瘤微環(huán)境的重要組成部分,與乳腺癌細胞的 “癌 - 免疫細胞” 串擾在腫瘤進展中起到關鍵作用。近日,中國農業(yè)大學的研究團隊發(fā)表于《Oncogene》的一項研究“Circular RNA CLASP1 modulates the GLI1/SNAIL axis and enhances macrophage polarization in breast cancer”,深入探討了 circCLASP1 在乳腺癌中的作用及分子機制,為乳腺癌的診斷和治療提供了新的靶點和思路。
Figure 1. Graph abstract
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circCLASP1 在乳腺癌組織和血清中高表達,具備診斷潛力
研究團隊通過重分析 GEO 數(shù)據集(GSE71651),篩選出在乳腺癌中差異表達顯著的 circRNAs,發(fā)現(xiàn) circCLASP1 是其中表達上調最為明顯的分子之一。為驗證這一結果,研究者檢測了65例乳腺癌組織、42 ?例癌旁組織、61 例乳腺癌患者血清及 10 例正常血清樣本中 circCLASP1 的表達水平,證實 circCLASP1 ?在乳腺癌組織和血清中均顯著高表達。此外,circCLASP1 的表達與淋巴結轉移、ki67 表達及腫瘤大小呈正相關,且其半衰期長于線性 ?CLASP1 mRNA,能抵抗 RNase R 消化,主要定位于細胞質中。這些結果表明,circCLASP1 具有作為乳腺癌診斷生物標志物的潛力。

Figure 2. 癌癥中circCLASP1的鑒定與表征
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circCLASP1 促進乳腺癌細胞增殖、遷移和侵襲
為明確 circCLASP1 的生物學功能,研究人員設計靶向其反向剪接位點的 shRNA,在乳腺癌細胞系中成功敲低 circCLASP1 表達。功能實驗顯示,敲低 ?circCLASP1 后,MDA-MB-231 和 MCF-7 細胞的增殖能力、集落形成能力顯著下降,ki67 ?陽性細胞比例減少,患者來源類器官(PDO)的生長速度和直徑也明顯降低。同時,Transwell 實驗證實,敲低 circCLASP1 ?能顯著抑制乳腺癌細胞的遷移和侵襲能力。細胞周期和凋亡分析顯示,敲低 circCLASP1 可導致細胞周期停滯,凋亡細胞數(shù)量增加,且 BAX ?蛋白水平升高、BCL2 蛋白水平降低。體內實驗進一步驗證,敲低 circCLASP1 的乳腺癌細胞在裸鼠體內形成的移植瘤重量顯著減輕。上述結果表明,circCLASP1 在乳腺癌中發(fā)揮癌基因作用,促進腫瘤細胞的增殖、遷移和侵襲。
Figure 3. CircCLASP1在BC細胞中作為致癌基因發(fā)揮作用
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U2AF2 調控 circCLASP1 的生物合成,參與乳腺癌惡性表型調控
RNA 結合蛋白(RBPs)可通過結合 circRNA 的側翼序列調控其生物發(fā)生。研究通過整合 3 個 RBP 預測數(shù)據庫,篩選出可能參與 circCLASP1 生物發(fā)生的關鍵上游調控因子 PTBP1 和 U2AF2。功能獲得實驗顯示,過表達 ?U2AF2 能顯著增加 circCLASP1 的表達,而過表達 PTBP1 對 circCLASP1 表達無明顯影響。WB結果證實 U2AF2 ?在乳腺癌組織中高表達,且在淋巴結陽性和 ki67 陽性的乳腺癌患者中,U2AF2 高表達與總生存期縮短相關。相關性分析顯示,U2AF2 與 ?circCLASP1 的表達呈正相關。RIP實驗進一步證實,U2AF2 通過結合 circCLASP1 側翼序列的 “+112~+136” ?區(qū)域調控其生物發(fā)生。拯救實驗表明,過表達U2AF2 可增強乳腺癌細胞的增殖、遷移和侵襲能力,而敲低 circCLASP1 能部分逆轉這一效應。
Figure 4. U2AF2介導circCLASP1的生物合成
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circCLASP1 不通過海綿化 miRNA 或編碼多肽發(fā)揮作用
考慮到circRNA常通過miRNA 海綿機制調控功能,且circCLASP1 主要定位于細胞質,研究者推測其可能作為 miRNA 海綿調控乳腺癌進展。RIP 實驗顯示 circCLASP1 能與 AGO2 結合,通過生物信息學預測和篩選,確定 miR-15a-5p 為其潛在靶標。RNA ?pull-down 和雙熒光素酶報告實驗證實,circCLASP1 可與 miR-15a-5p ?直接結合。然而,拯救實驗表明,miR-15a-5p 過表達無法顯著抑制 circCLASP1 ?過表達介導的乳腺癌細胞增殖、集落形成及遷移侵襲。這些結果表明,circCLASP1 并非通過海綿化 miRNA 或編碼多肽發(fā)揮癌基因功能。
Figure 5. CircCLASP1促進乳腺癌進展而不作為微小RNA的海綿
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circCLASP1 結合 CCT2,抑制 GLI1 的泛素化降解
為進一步探究 circCLASP1 的作用機制,研究人員通過 RNA pull-down 結合質譜分析,篩選出與 circCLASP1 相互作用的蛋白質,發(fā)現(xiàn)分子伴侶 CCT2 是其特異性結合蛋白。RIP 實驗驗證了 circCLASP1 與 CCT2 的相互作用,且 AlphaFold3 模擬顯示二者存在穩(wěn)定的結合結構。免疫共沉淀實驗表明,敲低 circCLASP1 會減弱 CCT2 與 GLI1 的相互作用,且 circCLASP1、CCT2 和 GLI1 形成復合物。進一步研究發(fā)現(xiàn),敲低 ?circCLASP1 不影響 GLI1 的 mRNA 水平,但會降低其蛋白穩(wěn)定性。CHNO?(CHX)追蹤實驗顯示,敲低 circCLASP1 ?會縮短 GLI1 的蛋白半衰期,而蛋白酶體抑制劑 MG132 可逆轉這一效應。泛素化實驗證實,敲低 circCLASP1 會增加 GLI1 ?的泛素化水平。在蛋白檢測過程中,研究使用了AtaGenix提供的 CDK4 抗體,為實驗結果的可靠性提供了有力支持。這些結果表明,circCLASP1 通過結合 CCT2,抑制 GLI1 的泛素化介導降解,從而穩(wěn)定 GLI1 蛋白。
Figure 6. CirCCLASP1結合到CCT2并調節(jié)GLI1的泛素介導降解
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circCLASP1 通過GLI1/SNAIL軸調控乳腺癌進展
GLI1 作為轉錄因子,其核積累是發(fā)揮功能的關鍵。免疫印跡和核質分離實驗顯示,敲低 ?circCLASP1 會抑制 GLI1 的核積累。生存分析表明,GLI1 下游靶基因 SNAIL 高表達的乳腺癌患者總生存期顯著縮短,且 ?GLI1 與 SNAIL 在乳腺癌中呈正相關。實驗證實,敲低 circCLASP1 會顯著降低 SNAIL 的 mRNA 和蛋白水平,且 ?circCLASP1 與 SNAIL 在乳腺癌組織中表達呈正相關。過表達野生型或 miR-15a-5p 結合位點突變型 ?circCLASP1,均能增強乳腺癌細胞的增殖、集落形成及遷移侵襲能力,且不影響 CCT2 與 GLI1 的相互作用和 SNAIL ?的表達。這些結果表明,circCLASP1 通過 CCT2/GLI1/SNAIL 軸促進乳腺癌進展,且該過程不依賴于 miR-15a-5p。
Figure 7.CircCLASP1通過GLI1在轉錄水平上調控SNAIL的表達
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circCLASP1 通過 SNAIL 調控巨噬細胞招募和極化,促進肺轉移
為探究 circCLASP1 對腫瘤微環(huán)境的影響,研究者通過免疫組化檢測發(fā)現(xiàn),circCLASP1 ?低表達的乳腺癌組織中 CD68 陽性巨噬細胞數(shù)量顯著減少,而 CD3 陽性 T ?細胞數(shù)量無明顯差異。條件培養(yǎng)基共培養(yǎng)實驗顯示,circCLASP1 過表達的乳腺癌細胞條件培養(yǎng)基可促進 THP-1 細胞向 M2 ?型巨噬細胞極化,而敲低 circCLASP1 則抑制這一過程。RT-qPCR 結果證實,circCLASP1 可調控乳腺癌細胞中 CCL2 和 ?CCL5 的表達,實時共培養(yǎng)實驗顯示,circCLASP1 過表達的乳腺癌細胞能顯著招募巨噬細胞,Transwell ?實驗進一步驗證了這一結果。體內實驗中,通過尾靜脈注射 4T1 細胞構建肺轉移模型,證實 circCLASP1 過表達可促進乳腺癌肺轉移,增加 ?Snail 表達和巨噬細胞招募,而敲低 Snail 能逆轉這些效應。這些結果表明,circCLASP1 通過 SNAIL 調控 CCL2 和 CCL5 表達,進而促進巨噬細胞招募和 M2 極化,加速乳腺癌轉移。

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Figure 8. CircCLASP1增強巨噬細胞在BC細胞中的募集
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本研究系統(tǒng)探討了 circCLASP1 在乳腺癌中的作用及分子機制,發(fā)現(xiàn) circCLASP1 在乳腺癌組織和血清中高表達,其表達水平與臨床病理特征相關,具備作為診斷生物標志物的潛力。功能上,circCLASP1 ?通過 U2AF2 介導的生物發(fā)生途徑產生,作為分子支架結合 CCT2,抑制 GLI1 的泛素化降解,促進 GLI1 核積累,進而上調 ?SNAIL 表達,通過 CCL2/CCL5 軸招募并極化巨噬細胞,最終促進乳腺癌細胞增殖、遷移、侵襲及肺轉移。該研究揭示了 circCLASP1 ?在乳腺癌進展中的關鍵作用及調控網絡,為乳腺癌的診斷和治療提供了新的靶點。
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abinScience為本研究提供了anti-CDK4抗體(HY215014),蛋白水平的精準檢測為機制驗證提供了關鍵支撐,助力科研團隊清晰揭示 circCLASP1通過CCT2/GLI1/SNAIL軸調控乳腺癌進展的分子鏈條。
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