簡介
2'-脫氧-2-氟胞苷為白色固體粉末,可溶于甲醇、吡啶等有機溶劑。在核苷化學合成領域,該化合物既可以作為起始原料,和叔丁基二甲基氯硅烷發(fā)生羥基保護反應,制備5'-O-TBS保護的核苷中間體;該化合物也可作為重要的合成中間體,經過甲醛改性反應得到取代修飾的尿苷衍生物。

2'-脫氧-2-氟胞苷的性狀
合成
通過在室溫下用濃氫氧化銨(4.26 mL,81.2 mmol)在二惡烷中處理受保護的三唑-1-基衍生物6小時,得到2'-脫氧-2'-氟代胞苷。溶劑蒸發(fā)后,將油狀物在甲醇中的半飽和(在冰溫下)氨中攪拌16小時。蒸發(fā)溶劑,2'-脫氧-2'-氟代胞苷從乙酸乙酯-甲醇(v/v,75:25)中結晶。無色晶體2'-脫氧-2-氟胞苷,產率1.24g,75%[1]。
用途
2'-脫氧-2-氟胞苷作為反應底物,和TBSCl發(fā)生羥基保護反應,用來制備5'-O-TBS保護的核苷中間體。例如:在室溫(R.T.)下,向2'-脫氧-2-氟胞苷(10.0 g,40.8 mmol)在無水吡啶(100 mL)中的冰冷溶液中滴加TBCl在吡啶(1M,53 mL)中。將反應混合物在室溫下攪拌16小時。然后用水淬滅反應混合物,濃縮得到殘余物。殘余物用乙酸乙酯(EA)和飽和NaHCO3水溶液分離。解決方案。將有機相干燥并濃縮。殘余物在硅膠柱(DCM中的5%MeOH)上純化,得到粗5'-O-TBS保護的中間體。白色固體,產率(13.4g,91%)[2]。
此外,2'-脫氧-2-氟胞苷為中間產物,經甲醛參與轉化后用來制備5'-O-叔丁基二苯基甲硅烷基-2'-O-[(2-甲氧基肟氧基)乙基]-5-甲基尿苷核苷衍生物。例如:將2'-O-([2-鄰苯二甲酰亞胺氧基)乙酯]-5'-叔丁基二苯甲硅烷基-5-甲基尿苷(3.1g,4.5mmol)溶解在干燥的CH2Cl2(4.5mL)中,并在-10°C至0°C下滴加甲基肼(300mL,4.64mmol)。1小時后,過濾混合物,用冰冷的CH2Cl2洗滌濾液,用水、鹽水洗滌合并的有機相,用無水Na2SO4干燥。將溶液濃縮得到2'-脫氧-2-氟胞苷,然后將其溶解在甲醇(67.5mL)中。向該甲醛(20%水溶液,w/w,1.1當量)中加入,將所得混合物攪拌1小時。真空下除去溶劑;殘余物經色譜分離得到5'-O-叔丁基二苯基甲硅烷基-2'-O-[(2-甲氧基肟氧基)乙基]-5-甲基尿苷。白色泡沫,產量1.95克,78%[3]。
參考文獻
[1] Crooke S T. Method of activating cellular doublestranded RNase with oligonucleotides containing at least four consecutive ribonucleosides and a modified ribonucleoside[P]. WO2004097049 A1,2004-11-11.
[2] Beigelman L. Preparation of amino acidsubstituted nucleosides, nucleotides and analogs as antiviral agents: WO2013096679 A1 [P].2013-06-27.
[3] Dobie K W. Antisense modulation of estrogen receptor beta expression for treatment of cancer: WO2003050133 A1[P].2003-06-19.