Apaf-1是一種分子量為130kD的蛋白質(zhì)，其存在于細(xì)胞質(zhì)中。人Apaf-1基因位于染色體12q23。Apaf-1 由三部分特殊的結(jié)構(gòu)域組成：①N-末端為85 個氨基酸殘基，含有一個半胱氨酸蛋白酶募集域，稱為CARD結(jié)構(gòu)域，可結(jié)合N端具有同源性的caspase-9。②是和CED-4有很高同源性，含320個氨基酸殘基的區(qū)域，CED-4同源域內(nèi)包含一個保守的P環(huán)，與dATP/ATP結(jié)合，可促進自身的多聚化。③C-末端有12個WD-40重復(fù)片段，其阻礙自身多聚化，當(dāng)它與細(xì)胞色素c結(jié)合，改變Apaf-1的構(gòu)象，消除了對Apaf-1自身多聚化的阻礙作用，使Apaf-1與procaspase-9結(jié)合并啟動其活化過程。