甲基嘧啶磷作為低毒殺蟲劑，主要用于防治谷物、倉(cāng)庫(kù)及家庭公共衛(wèi)生類害蟲，常作為儲(chǔ)糧保護(hù)劑，也可搭配其他農(nóng)藥防治抗性害蟲，還能用于糧食種子處理、制作滅鼠毒餌。

甲基嘧啶磷是膽堿酯酶抑制劑，具有觸殺和熏蒸作用。它能滲透到葉面組織，有葉面?zhèn)鲗?dǎo)作用，廣泛用于防治倉(cāng)庫(kù)、糧倉(cāng)、畜舍、庭院及工業(yè)廠房?jī)?nèi)的害蟲與螨。特別是防治西紅柿、黃瓜、辣椒、茄子等蔬菜中的白蠅、薊馬科害蟲、粉蚧科的蚧殼蟲、蚜蟲和螨有良好的效果，藥效持久。目前甲基嘧啶磷最重要的作用是倉(cāng)儲(chǔ)害蟲的防治。