全基因組重測序是對基因組序列已知的個體進(jìn)行全基因組測序，在個體或群體的基因組(DNA)水平進(jìn)行差異性分析的方法。利用二代測序，基于人類參考基因組序列進(jìn)行全基因組測序，可以更全面地挖掘基因序列差異和結(jié)構(gòu)變異，在全基因組水平上掃描并檢測與表型差異、疾病。

梅花全基因組重測序的完成將為其分子標(biāo)記輔助育種的研究提供重要的理論框架，也將在應(yīng)用上為其花色、花型、株型等重要觀賞性狀基因的遺傳選育及品種改良提供重要平臺，對梅花重要觀賞性狀的遺傳解析具有里程碑的作用。

對已有參考基因組序列的物種進(jìn)行個體或群體全基因組測序稱為全基因組重測序。全基因組重測序結(jié)果與已有參考基因組序列進(jìn)行比對，檢測出全基因組范圍的單核苷酸多態(tài)、插入缺失突變、拷貝數(shù)變異和機(jī)構(gòu)變異等變異信息，獲得個體或群體分子遺傳特征，進(jìn)行動物重要經(jīng)濟(jì)性狀候選基因預(yù)測及遺傳進(jìn)化分析，廣泛應(yīng)用于遺傳變異檢測、性狀基因定位、遺傳圖譜構(gòu)建和遺傳進(jìn)化研究。